Bio Informaticien en Recherche Developpeur Gestionnaire Pipelines Bioinformatiques . H/F - Fédération Hospitalière de France

Descriptif Grade Grille de référence I.H.
Type de contrat Contractuels acceptés
Pourcentage d'activité 100%
DÉFINITION :
Immun4Cure (I4C) est institut hospitalo-universitaire (IHU) dont l'objectif est de développer de nouvelles thérapies innovantes afin de lutter contre les maladies auto-immunes. Ce projet ambitieux repose tout d'abord sur un volet clinique important comprenant différentes cohortes de patients associées à différentes maladies auto-immunes comme le lupus, l'arthrite rhumatismale ou la sclérodermie. Par ailleurs, I4C fonde aussi son effort sur de la recherche fondamentale autour de l'auto-immunité centrée sur les pathologies visées en clinique. Les travaux de recherche tant fondamentaux qu'auprès des patients impliquent des technologies de génomique à haut débit et donc des données volumineuses et complexes. Ces données seront acquises selon des modalités diverses : transcriptomique, protéomique, séquençage de l'ADN, imagerie. Les technologies utilisées seront-elles aussi diverses et parmi les plus avancées : cellules uniques, biologie spatiale, images, séquençage Illumina mais aussi en long reads, etc
Horaires : 9h-18h Repos : samedi-dimanche
ACTIVITÉS PRINCIPALES :
Développement de scripts implémentant les pipelines génomique et transcriptomique
Gestion des versions de ces scripts.
Développement des progiciels et programmation nécessaires à l'exploitation des données biologiques et médicales
Formation de personnes aux techniques et procédures de son domaine, et à leur application
Paramétrage des outils, logiciels, systèmes relevant de son domaine d'activité
Participation aux publications scientifiques et médicales en interne ou externe
Traitement et analyse de l'information/données médicale et/ou biologique : extraction, regroupement, représentation graphique
Veille professionnelle
ACTIVITÉS SPÉCIFIQUES LIÉES AU POSTE :
Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports, brevets, publications, présentations orales.
Analyse des données OMICS (génomique et transcriptomique)
CORRESPONDANCE STATUTAIRE (grade) :
Ingénieur hospitalier
Catégorie A