Bio Informaticien en Recherche Developpeur Gestionnaire Pipelines Bioinformatiques . H/F - Fonction publique Hospitalière

Grade Grille de référence I.H.

Type de contrat Contractuels acceptés

Pourcentage d'activité 100%

DÉFINITION :

Immun4Cure (I4C) est institut hospitalo-universitaire (IHU) dont l'objectif est de développer de nouvelles thérapies innovantes afin de lutter contre les maladies auto-immunes. Ce projet ambitieux repose tout d'abord sur un volet clinique important comprenant différentes cohortes de patients associées à différentes maladies auto-immunes comme le lupus, l'arthrite rhumatismale ou la sclérodermie. Par ailleurs, I4C fonde aussi son effort sur de la recherche fondamentale autour de l'auto-immunité centrée sur les pathologies visées en clinique. Les travaux de recherche tant fondamentaux qu'auprès des patients impliquent des technologies de génomique à haut débit et donc des données volumineuses et complexes. Ces données seront acquises selon des modalités diverses : transcriptomique, protéomique, séquençage de l'ADN, imagerie. Les technologies utilisées seront-elles aussi diverses et parmi les plus avancées : cellules uniques, biologie spatiale, images, séquençage Illumina mais aussi en long reads, etc

Horaires : 9h-18h Repos : samedi-dimanche

ACTIVITÉS PRINCIPALES :

Développement de scripts implémentant les pipelines génomique et transcriptomique

Gestion des versions de ces scripts.

Développement des progiciels et programmation nécessaires à l'exploitation des données biologiques et médicales

Formation de personnes aux techniques et procédures de son domaine, et à leur application

Paramétrage des outils, logiciels, systèmes relevant de son domaine d'activité

Participation aux publications scientifiques et médicales en interne ou externe

Traitement et analyse de l'information/données médicale et/ou biologique : extraction, regroupement, représentation graphique

Veille professionnelle

ACTIVITÉS SPÉCIFIQUES LIÉES AU POSTE :

Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports, brevets, publications, présentations orales.

Analyse des données OMICS (génomique et transcriptomique)

CORRESPONDANCE STATUTAIRE (grade) :

Ingénieur hospitalier

Catégorie A