Ingénieur Bioinformaticien en Analyse de Données Omiques H/F - Ministère de l'enseignement supérieur et de la recherche

Activités principales de l'agent·e :
- Mettre en place et participer à des projets d'analyse/fouille de données de séquences à haut débit (génome/transcriptome/traductome/protéome)
- Déployer et assurer la maintenance de services bioinformatiques en ligne sur différentes plateformes (cluster local, cloud, serveurs web)
- Assurer une veille technologique sur les bonnes pratiques de développement et sur les méthodologies pertinentes pour les équipes d'accueil
- Diffuser et valoriser des savoir-faire bioinformatiques dans l'I2BC via une participation aux activités de la plateforme de bioinformatique de l'unité (20% du service)
- Conseiller et former aux techniques et outils développés
- Encadrer des stagiaires de niveau L2 à M2 (un à deux par an)
- Recueil, analyse et traitement des données

Connaissances, savoirs :
- Connaissance approfondie des outils et concepts utilisés en bioinformatique des génomes (génome/transcriptome/protéome)
- Recueil, analyse et traitement des données (connaissance approfondie)
- Biologie (connaissance générale)
- Master en bioinformatique
- Anglais niveau B1

Savoir-faire :
- Maîtrise des langages Python et R
- Maîtrise d'au moins un gestionnaire de workflow (Nextflow et/ou Snakemake)
- Expérience en production de conteneurs Linux (Docker, Singularity/Apptainer)
- Bonne pratique de la maintenance de code et de la gestion de versions (git, github/gitlab)
- Connaissance approfondie des bases de données de séquences, de l'analyse des données NGS et de l'analyse de réseaux biologiques
- Maîtrise de la conception et la maintenance en Base de Données relationnelles (PostgreSQL)

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Savoir-être :
- Sens du relationnel et de la communication
- Curiosité scientifique et technique, dynamisme
- Capacité à gérer de nombreuses interactions et à travailler sur des projets variés