Ingenieur d'Etudes en Enzymologie H/F - Ministère de l'enseignement supérieur et de la recherche
- Toulouse - 31
- CDD
- Ministère de l'enseignement supérieur et de la recherche
Les missions du poste
Le projet CORNFLEX se concentre sur une application de preuve de concept particulière : la conception de linkers IDP flexibles dans des protéines multi-modulaires (présentant un domaine catalytique : une xylanase et un domaine de reconnaissance du substrat xylane : carbohydrate binding module, CBM) afin d'améliorer leur activité hydrolytique pour la déconstruction de la paroi cellulaire de plante. La biomasse végétale présentant un vaste potentiel en tant que ressource renouvelable. Ainsi, les résultats du projet CORNFLEX visent (i) à maitriser la prédiction de la flexibilité d'IDPs et, à travers la preuve de concept, (ii) à apporter des solutions méthodologiques pour aider à construire une économie durable sur le plan environnemental.
Missions et activités du poste
La personne recrutée sur ce poste interviendra dans un work package de validation fonctionnelle impliquant deux partenaires toulousains du projet CORNFLEX (TBI, LRSV). La personne sera recrutée par TBI avec une convention d'accueil pour ses activités au LRSV. Ce work package doit permettre d'apporter une validation biologique aux modèles de linker. Pour cela, le/la candidate produira par expression hétérologue dans E. coli les différentes protéines chimériques du projet et les purifiera (TBI). Il/elle s'assurera de leur activité enzymatique in vitro par des tests colorimétriques déjà établis, sur des substrats solubles et insolubles (TBI). Il/elle étudiera leur activité enzymatique in situ sur des coupes sériées de plantes modèles par immunocytochimie, permettant in fine de suivre par imagerie in situ l'évolution du substrat résiduel suite à l'action des protéines chimères (LRSV).
Dans ce cadre, vos missions seront les suivantes :
- Produire et purifier les protéines chimériques (TBI)
- Doser les activités enzymatiques in vitro (TBI)
- Mesurer les affinités du domaine de liaison aux sucres in vitro (TBI)
- Préparer les échantillons pour la microscopie (inclusion, microtomie) (LRSV)
- Réaliser des tests d'activité enzymatique sur coupe (LRSV)
- Réaliser les marquages immunocytochimiques après action enzymatique (LRSV)
- Analyser les images obtenues (LRSV)
- Assurer un suivi bibliographique et être force de proposition sur le projet (TBI, LRSV)
- Communiquer régulièrement, avoir le sens du travail en équipe (TBI, LRSV)
- Gérer les stocks et effectuer les commandes nécessaires (TBI, LRSV).
Références bibliographiques :
- Francoz E, Ranocha P, Le Ru A, Martinez Y, Fourquaux I, Jauneau A, Dunand C, Burlat V. Pectin Demethylesterification Generates Platforms that Anchor Peroxidases to Remodel Plant Cell Wall Domains. Dev Cell. 2019;48(2) :261-276.e8. DOI : 10.1016/j.devcel.2018.11.016
- Badruna L, Burlat V, Montanier CY. CBMs as probes to explore plant cell wall heterogeneity using immunocytochemistry. Meth Mol Biol. 2017;1588 :181. DOI : 10.1007/978-1-4939-6899-2\_14
Le profil recherché
Profilrecherché
De formation initiale niveau ingénieur et/ou titulaire d'un Master Recherche ou supérieure, vous bénéficiez d'une expérience dans le domaine de la Biochimie/Enzymologie.
Compétences et connaissances attendues
- Maîtrise de l'expression de protéines hétérologues dans E. coli ;
- Maîtrise de la purification de protéines recombinantes ;
- Maîtrise/connaissance des techniques de microscopie à fond clair et/ou en fluorescence ;
- Maîtrise/connaissance des techniques d'analyse d'image ;
- Connaissances théoriques et pratiques en enzymologie et biochimie des protéines ;
- Connaissances des techniques classiques de biologie moléculaire et de clonage ;
- Autonomie, rigueur, créativité et souci des délais impartis ;
- Maîtrise de l'anglais (notamment pour la présentation des résultats aux partenaires non francophone de TBI, LRSV et des autres partenaires de CORNFLEX.
- Un goût pour les sujets interdisciplinaires est crucial.
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Contrat
- CDD de 18 mois, renouvelable, période d'essai de 3 mois.
- Date de début du contrat : 1er octobre 2025
- En fonction de la grille de rémunération fonction publique des ingénieurs d'études de recherche et de formation, reprise d'ancienneté et expériences
- Horaire hebdomadaire 37h30
- Congés annuels 45 jours + RTT pour un temps plein.