Chercheur - Ingénieur en Bio-Informatique Auprès du Professeur Denis Duboul H/F - Collège de France 1530
- Paris - 75
- CDD
- Collège de France 1530
Les missions du poste
Contexte
Notre laboratoire s'intéresse à la compréhension des événements génétiques précoces au cours de la spécification axiale chez les mammifères. En raison des difficultés à étudier ces processus dans l'embryon, nous utilisons un système de substitution in vitro qui reproduit ces étapes et nous fournit un matériel suffisant pour étudier l'élongation axiale à la fois au niveau moléculaire et cellulaire. Nous utilisons des méthodes de biologie moléculaire pour étudier l'état transcriptionnel des gastruloïdes en développement (bulk RNA-seq, scRNA-seq), la chromatine en 2D (ATAC-seq, ChIP-seq) et la chromatine en 3D (Hi-C, Micro-C). En outre, nous utilisons des techniques d'imagerie pour visualiser l'activité de certains gènes du développement.
Mission
Vous fournirez un soutien en bioinformatique et en analyse computationnelle dans le domaine de l'organisation de la chromatine au cours de la régulation des gènes au cours du développement au sein du laboratoire. Votre mission consiste à assister les membres du laboratoire dans ces analyses bioinformatiques à l'aide d'un serveur local Galaxy associé au laboratoire. En, vous ferez partie de la communauté mondiale dynamique et solidaire de Galaxy.
Connaissances et compétences
- Expérience dans l'analyse de grands ensembles de données génomiques et de bio-statistiques est souhaitable (c'est-à-dire Hi-C, Micro-C, scRNA-seq, bulk RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq)
- Connaissance théorique et pratique de la programmation/biostatistique (R, bash, python)
- Une certaine connaissance de la biologie du développement et de la régulation des gènes serait un plus
- Bonne maîtrise de l'anglais
Profil recherché
Niveau d'études : Diplôme de troisième cycle (MSc/PhD) en biologie informatique, bioinformatique ou biostatistique
Une expérience dans l'un de ces domaines serait un plus
Le profil recherché
Profil recherché
Niveau d'études : Diplôme de troisième cycle (MSc/PhD) en biologie informatique, bioinformatique ou biostatistique
Une expérience dans l'un de ces domaines serait un plus
Pour toute information supplémentaire ou scientifique, peut être obtenue directement à l'adresse maildu professeur Duboule : ****@****.**