Ingénieur d'Étude Chémoinformatique et Chimothécaire H/F - Universite Grenoble Alpes

Ancrée sur son territoire, pluridisciplinaire et ouverte sur l'international, l'Université Grenoble Alpes rassemble, depuis le 1er janvier 2020, les forces de l'enseignement supérieur public de Grenoble et Valence.
En association avec les organismes nationaux de recherche et les grands instruments internationaux présents sur son territoire, elle construit sa politique de recherche et d'innovation à l'échelle mondiale.Présentation de la structure :
Le Département de Pharmacochimie Moléculaire (DPM) mène des recherches dans le domaine de la santé autour de la chimie et de la physicochimie du médicament. Le DPM fait partie de l'Institut Chimique Moléculaire de Grenoble (ICMG) et gère la Chimiothèque Grenobloise qui est intégrée à la Chimiothèque Nationale (ChemBioFrance). Pour en savoir plus sur le DPM : https://dpm.univ-grenoble-alpes.fr/

Missions principales :
Vous aurez comme mission principale de mettre en oeuvre et d'exploiter des outils de chimio-informatique, tant pour les projets scientifiques menés au sein de l'unité que pour la gestion et la valorisation de la chimiothèque, à l'échelle locale et nationale.

Activités :
Exploitation des données de la recherche :
- Explorer la structure 3D des macromolécules (protéines, acides nucléiques) en étudiant leurs motifs évolutifs sur la séquence protéique à l'aide des techniques d'apprentissages profondes (modèles de langage, diffusion, etc.)
- Utiliser des modèles d'apprentissage profond pour l'étude des interactions moléculaires, des approches thérapeutiques (créer des nouvelles candidatures médicamenteuses en se basant sur la structure et les signaux physico-chimiques des sites d'interaction de la protéine) et entre biomacromolécules pour des approches analytiques
- Construire des modèles d'étude par l'apprentissage automatique (machine learning)-apprentissage profonde (Deep learning) avec préparation / nettoyage des données moléculaires
- Analyser des données par des méthodes statistiques : SAR, QSAR, QSPR, calcul de descripteurs, analyse de diversité, recherche d'analogues, élaboration de bibliothèques virtuelles

Modélisation moléculaire :
- Effectuer des docking et criblages virtuels : aspect structural des biomacromolécules (protéines, acides nucléiques etc.) et des petits ligands

Chimiothèque :
- Assurer la gestion et la mise en valeur des données structurales et biologiques
- Assurer, avec l'appui de techniciens, la collecte et la gestion des échantillons
- Participer à la gestion administrative de la chimiothèque de l'ICMG et aux activités de la chimiothèque nationale (ChemBioFrance)

Activités secondaires :
- Apporter un soutien à la gestion des ressources informatiques communes de l'unité

Experience : 24 Mois

Compétences : Langages de programmation : Bash, Python et/ou R, Savoir rédiger des documentations techniques, Constructions et entrainements de modèles de Deep,Langages de requête de type SQL, HTML, PHP,Connaitre l'administration de système Linux, Avoir une communication interdisciplinaire,Analyse de données, exploiter des bases de données, Connaissances paquets, logiciels chemoinformatiques, Connaissances paquets, logiciels moléculaires, Constructions, entrainements modèles Deep learning

Qualification : Cadre

Secteur d'activité : Enseignement supérieur

Liste des qualités professionnelles :
Faire preuve d'autonomie : Capacité à prendre en charge son activité sans devoir être encadré de façon continue (le cas échéant, à solliciter les autres acteurs de l'entreprise).
Faire preuve de rigueur et de précision : Capacité à réaliser des tâches en suivant avec exactitude les règles, les procédures, les instructions qui ont été fournies, sans réaliser d'erreur et à transmettre clairement des informations. Se montrer ponctuel et respectueux des règles de savoir-vivre usuelles.
Organiser son travail selon les priorités et les objectifs : Capacité à planifier, prioriser, anticiper des actions, en tenant compte des moyens, des ressources, des objectifs et du calendrier pour les réaliser.