Bio-Informaticien H/F - Ministère du Travail, de la Santé et des Solidarités

Vos missions

Rattaché à l'équipe bio-informatique de l'Unité de Génétique Virale et Biosécurité, vous assurerez, en coordination avec les autres membres de l'équipe, les analyses de données de séquençage (virales, bactériennes, Illumina Nextseq Miseq, MinION). Vous pourrez vous appuyer sur un environnement déjà en place (gitlab, galaxy, slurm, limms interne) sous environnement linux. En fonction de vos compétences, pourront s'y adjoindre des tâches d'administration système ou réseau (Ubuntu, slurm, nfs), de sauvegarde, de soumission aux banques de données publiques et/ou d'automatisation. Vous serez impliqué dans des activités de développement et de recherche de l'unité en fonction de ses affinités (analyses viralesou bactériennes, Machine Learning, OGM).

Votre quotidien
- Analyse de données de séquençage : en routine et exploratoire.
- Monter et participer à des projets de recherche, développer de nouveaux outils bio-informatiques dédiés aux analyses en lien avec les missions de l'Anses et particulièrement -travaux sur virus, bactéries et leurs interactions avec leurs hôtes.
- Support de l'infrastructure informatique mise en place par l'équipe bioinfo (slurm, sauvegardes, applications Django, Galaxy et wrappers)
- Valorisation des travaux par des articles, communications aux niveaux national et international

De formation Bac +5 à Bac +8 en bio-informatique, vous avez un goût prononcé pour la recherche, avez des connaissances biologiques générales, et un attrait pour les statistiques et la programmation.