Postdoctorant en Biochimie - Biologie Moléculaire - Biophysique des Complexes Protéiques de la Réplication de l'Adn des Archaea H/F - Ifremer

Rejoignez l'Ifremer pour un océan mieux compris, mieux protégé qui demeure un allié du bien-vivre sur la planète

Des abysses à la surface, de la côte au large, l'Ifremer est l'institut de recherche français entièrement dédié à l'Océan. Ses équipes mènent des recherches, innovent et produisent des expertises pour protéger l'océan, exploiter ses ressources de manière responsable et partager les données marines.

L'Ifremer apporte son expertise scientifique pour éclairer les politiques publiques et élabore des solutions puisées dans l'océan pour répondre aux enjeux de la transition écologique. Opérateur de la Flotte océanographique française avec sa filiale d'armement Genavir, l'Ifremer imagine, conçoit et déploie des moyens technologiques de pointe pour percer les mystères de l'océan.

Rejoignez nos équipes, composées de 1500 scientifiques et métiers supports à la recherche, et présentes sur tout le littoral métropolitain et en Outre-mer.

www.ifremer.frDate de clôture de réception de candidatures : 01/09/2025

Le Laboratoire de Microbiologie des Environnements Extrêmes (LMEE) fait partie de l'unité mixte de recherche entre l'Ifremer (Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer) et l'UBO (Université de Bretagne Occidentale) UMR BEEP (Biologie et Ecologie des Ecosystèmes Marins Profonds) en association avec l'EMR Biomex CNRS (Biologie, Interactions et Adaptations des Organismes dans les Environnements Extrêmes) (https://www.umr-beep.fr). Les projets de recherche se concentrent sur l'adaptation et la réponse des organismes vivants dans l'océan profond. En particulier, l'équipe du Dr Ghislaine Henneke étudie les enzymes clefs des processus fondamentaux qui régissent l'homéostasie des génomes de modèles archéens, P. abyssi et T. barophilus. Il est question de comprendre comment l'intégrité du génome, un mécanisme central de la vie cellulaire, est maintenue dans ces micro-organismes provenant d'environnements extrêmes. Les recherches font appel à des approches expérimentales multidisciplinaires in vitro, ex vivo et in vivo (e.g., biochimie, physique, chimie, génétique, cultures en bioréacteurs, physiologie), ayant accès à des plateformes spécialisées et des installations technologiques locales.

Missions principales

Un poste de chercheur postdoctoral de 30 mois est disponible au sein du LMEE à l'Ifremer, Plouzané (France). Scientifiques très motivé(e)s, intéressé(e)s par la biochimie et la biophysique de la molécule unique pour étudier la dynamique et l'interaction fonctionnelle entre les composants du réplisome archée, sont invité(e)s à postuler. Les recherches de l'équipe du Dr Ghislaine Henneke sont centrées sur la compréhension du fonctionnement des protéines de réplication de l'ADN chez les archées anaérobies et hyperthermophiles, d'un point de vue qualitatif et quantitatif mais aussi in vivo et in vitro. La méthodologie repose sur l'utilisation de techniques en biologie moléculaire, biochimie, et spectroscopie pour caractériser les complexes protéiques des archées. L'objectif de cette étude est d'enrichir notre compréhension de la réplication de l'ADN des archées, qui possèdent une mosaïque de caractéristiques bactériennes et eucaryotes, constituant le domaine le plus inexploré de la vie. Ce travail fait partie d'un projet financé par l'Agence Nationale de la Recherche (ANR ARCHAREP : ANR-24-CE11-4405-02 ; 06/01/2025-03/01/2028).

Mots-clés : #protéine #réactions biochimiques d'ensemble #spectroscopie en molécule unique #Archaea #réplication et réparation de l'ADN

Activités principales

Le projet repose sur l'emploi d'approches multidisciplinaires en Biochimie (expression et purification de protéines, méthodes en enzymologie basées sur la fluorescence) ; Biophysique (spectroscopie de fluorescence à l'état stationnaire, microscopie de fluorescence en molécule unique) ; Biologie Moléculaire (Design et Construction d'ADN plasmidique codant des protéines et d'ADN matrices). Le/la candidat-e sera également impliqué-e dans la préparation d'échantillons de haute qualité pour des études structurales en collaboration avec l'équipe du Dr L. Sauguet (Architecture et dynamique des macromolécules biologiques) à l'Institut Pasteur (Paris), et sera associé-e aux analyses de la structure des protéines. Les autres responsabilités comprennent la coordination de ses propres travaux de recherche et des nombreux aspects organisationnels (rédaction de rapports des données et autres tâches administratives). Des présentations régulières des travaux sont attendues lors de séminaires d'équipe et des réunions du projet ANR. Ce poste offre également une opportunité unique d'apprendre les techniques de pointe de la culture d'archée en bioréacteur à haute température.

Champs relationnel

Le/la chercheur va travailler en collaboration dans l'équipe « stabilité des génomes » du thème 3 « Réponses et adaptations des organismes profonds » de l'UMR BEEP. Il/elle pourra participer aux travaux d'analyses structurales en collaboration avec l'équipe du Dr L. Sauguet (Architecture et dynamique des macromolécules biologiques) à l'Institut Pasteur (Paris). Il/elle pourrait être amené à utiliser des équipements locaux de l'Université de Bretagne Occidentale (Brest).

- Doctorat
- Vous avez soutenu votre thèse depuis moins de 3 ans au démarrage du contrat.

Compétences techniques / métiers

Titulaire d'un doctorat en Biochimie des protéines (production et purification des protéines, western-blot, anisotropie de fluorescence, Résonance Plasmonique de Surface, caractérisation enzymatique de protéines des acides nucléiques est fortement souhaitée).

Expérience en Biologie Moléculaire (Design de constructions plasmidiques pour l'expression de protéines recombinantes, électrophorèse sur gel, qPCR, Design de matrices ADN pour la caractérisation enzymatique) serait appréciée.

Expérience dans un ou plusieurs des domaines suivants est souhaitée : interactions protéine/protéine ou protéine/ADN, caractérisation biophysique des protéines, protéomique.

Une expertise dans l'utilisation d'outils informatiques d'analyse des protéiques (et acides nucléiques) et une connaissance de logiciels indispensables (MS Office, statistiques...) sont requises.

Qualités personnelles

Le/la candidat-e doit être capable de travailler à la fois de manière indépendante et au sein d'une équipe pluridisciplinaire, posséder d'excellentes aptitudes à la communication écrite et orale. Il/elle doit être dynamique et avoir un esprit d'initiative. Il/elle démontre de bonnes aptitudes à la résolution de problèmes rencontrés pendant ses recherches et une implication dans le mentorat d'étudiants.