Assistant·e Ingénieur·e en Biostatistique ou Sciences de Données H/F - Ecole Nationale Veterinaire Agroaliment

Oniris, établissement public d'enseignement supérieur et de recherche du Ministère de l'Agriculture, de la Souveraineté et de l'Alimentation (MASA) a pour objectif principal de former des techniciens et des ingénieurs en agroalimentaire et des docteurs vétérinaires.
L'établissement compte environ 550 personnes et 1100 étudiants, sur deux campus, le campus vétérinaire à la Chantrerie et le campus sciences de l'alimentation à la Géraudière.Poste à pourvoir du 01/11/2025 au 31/10/2026
Lettre de motivation demandée

Le LABERCA (LABoratoire d'Étude des Résidus et Contaminants dans les Aliments) est une unité de recherche de l'École Nationale Vétérinaire, Agroalimentaire et de l'Alimentation (Oniris VetAgroBio Nantes), établissement public à caractère scientifique, culturel et professionnel (EPCSCP) placé sous la tutelle du ministre chargé de l'agriculture (MAP). Le LABERCA est une Unité Mixte de Recherche portée par Oniris et l'INRAE (département Alim H) dont les questions de recherche ciblent la sécurité chimique de l'aliment et s'inscrit dans une démarche globale et intégrée de caractérisation des expositions, depuis l'agrofourniture jusqu'à l'Homme et sa descendance.

Dans le cadre du projet ENDOFAT (ANR-JCJC2024) le LABERCA est en charge pour la conception et la réalisation d'une étude épidémiologique intégrative visant à étudier les associations entre exposition aux polluants organiques persistants (POPs) et le métabolome du tissu adipeux chez les patientes atteintes d'endométriose sévère. La présente étude sera développée sur un cohorte de 106 cas de femmes atteintes d'endométriose profonde, soit avec endométriome (endométriose ovarienne, OMA) ou sans endométriome (DE), confirmés par laparoscopie et histologie recrutées au CHU de Nantes. Pour toutes les femmes un dosage élargi de POPs et du métabolome a été réalisé par les plateformes HMB et MELISA du LABERCA, et seront analysés par le candidat retenu à l'aide de méthodes statistiques pour l'identification de biomarqueurs métaboliques et facteurs de risque chimique.

Activités principales du poste :

- Participer au développement du cadre analytique pour identifier les métabolites et les empreintes métaboliques uniques associés aux expositions aux POP modernes à l'aide de méthodes statistiques avancées

- Analyse de données métabolomiques et exposomiques à l'aide de méthodes statistiques type analyses par composantes principales (ACP), analyses discriminantes par les moindres carrés partiels (PLSDA), régression élastique net ou forêt aléatoire afin d'identifier les biomarqueurs les plus pertinents pour l'association avec les expositions aux POP.

- Des modèles de régression multivariée seront adaptés pour caractériser les associations en tenant compte des variables confondantes précédemment identifiées.

- Développement des script d'analyses de données en R adaptés aux questions du projet.

- Recherche et synthèse bibliographique

- Rédaction de rapports et articles scientifiques

- Le/la candidat(e) recruté(e) sera intégré(e) au réseau de recherche ENDOFAT, donc la participation aux réunions et activités d'animation du projet est aussi attendue.

Profil recherché :

Savoir être :
Travail en équipe
Faire preuve d'autonomie
Faire preuve de curiosité

Savoir faire :
Connaissance des principaux concepts en modélisation épidémiologique
Connaissance des étapes de retraitement des données à l'aide des outils statistiques
Connaissance en évaluation de risques chimiques

Compétences :
Modélisation régression multivariée
Statistique descriptive
Retraitement de données
Programmation R

Experience : 12 Mois

Qualification : Agent de maîtrise

Secteur d'activité : Enseignement supérieur