Ingénieur en Développement Logiciel pour l'Imagerie Médicale H/F - INRIA

A propos d'Inria

Inria est l'institut national de recherche dédié aux sciences et technologies du numérique. Il emploie 2600 personnes. Ses 215 équipes-projets agiles, en général communes avec des partenaires académiques, impliquent plus de 3900 scientifiques pour relever les défis du numérique, souvent à l'interface d'autres disciplines. L'institut fait appel à de nombreux talents dans plus d'une quarantaine de métiers différents. 900 personnels d'appui à la recherche et à l'innovation contribuent à faire émerger et grandir des projets scientifiques ou entrepreneuriaux qui impactent le monde. Inria travaille avec de nombreuses entreprises et a accompagné la création de plus de 200 start-up. L'institut s'eorce ainsi de répondre aux enjeux de la transformation numérique de la science, de la société et de l'économie.Ingénieur en développement logiciel pour l'imagerie médicale

Type de contrat : CDD

Niveau de diplôme exigé : Bac +4 ou équivalent

Autre diplôme apprécié : Diplôme d'ingénieur en Informatique, Bio-informatique ou Sciences des Données

Fonction : Ingénieur scientifique contractuel

Niveau d'expérience souhaité : De 3 à 5 ans

A propos du centre ou de la direction fonctionnelle

Le Centre Inria de l'Université Grenoble Alpes, regroupe un peu moins de 600 personnes réparties au sein de 22 équipes de recherche et 7 services support à la recherche.

Son effectif est distribué sur 3 campus à Grenoble, en lien étroit avec les laboratoires et les établissements de recherche et d'enseignement supérieur (Université Grenoble Alpes, CNRS, CEA, INRAE, ...), mais aussi avec les acteurs économiques du territoire.

Présent dans les domaines du calcul et grands systèmes distribués, logiciels sûrs et systèmes embarqués, la modélisation de l'environnement à différentes échelles et la science des données et intelligence artificielle, le Centre Inria de l'Université Grenoble Alpe participe au meilleur niveau à la vie scientifique internationale par les résultats obtenus et les collaborations tant en Europe que dans le reste du monde.

Contexte et atouts du poste

Contexte : NeuroVasc est un projet national, financé pour 4 ans par le programme PEPR Santé Numérique du plan national FRANCE 2030. NeuroVasc vise à développer un écosystème numérique optimal (fédérant une trentaine de sites hospitalo-universitaires) en intégrant des données multimodales (phénotypes, génomes, neuro-images) pour plus de 3 000 patients porteurs d'anévrismes intracrâniens (ICA). Cet écosystème sera déterminant pour i) mieux comprendre la physiopathologie des anévrismes intracrâniens et de l'AVC ischémique et ii) concevoir des modèles prédictifs pour une meilleure prise en charge des patients.
Shanoir (SHAring iN vivO Imaging Resources, ) est une plateforme qui permet le partage d'images médicales in vivo, avec leurs métadonnées, pour la recherche clinique et préclinique.

Spécificités :

- Le/la candidat.e évoluera dans une équipe interdisciplinaire comprenant des expert.es médicaux et scientifiques
- Le poste est situé dans le laboratoire de recherche de l'institut du thorax (Nantes), avec des échanges réguliers avec l'équipe de développement de Shanoir située à l'IRISA (Rennes) et au GIN (Grenoble)

Le poste nécessitera des déplacements en France dans le cadre d'un réseau déjà opérationnel d' Hôpitaux Universitaires.

Mission confiée

La personne recrutée aura pour mission d'accompagner les partenaires cliniques contribuant au projet national NeuroVasc en facilitant le transfert d'images médicales de haute qualité acquises en routine clinique vers l'entrepôt de données Shanoir. Le second objectif est de contribuer au développement logiciel de Shanoir (expérience utilisateur, interopérabilité, etc.).

Cet accompagnement consistera à
- coordonner le déploiement, sur site, de Shanoir Uploader dans les systèmes d'imagerie clinique (PACS)
- monitorer l'acquisition d'images médicales de qualité grâce à des règles de contrôle qualité et un tableau de bord des données d'imagerie,
- recueillir les besoins des cliniciens, techniciens, assistants de recherche et paramédicaux, pour améliorer l'expérience utilisateur et contribuer à l'évolution de Shanoir. Ces évolutions couvriront également la découvrabilité des jeux de données d'imagerie ainsi qu'une meilleure interopérabilité avec les infrastructures de données génomiques et cliniques développées dans NeuroVasc.

Principales activités

- Coordonner le déploiement sur site de Shanoir Uploader dans les systèmes d'imagerie clinique (PACS)
- Concevoir des règles de contrôle qualité pour les images médicales
- Développer un tableau de bord des données d'imagerie pour monitorer la contribution des centres participants
- Recueillir des besoins afin d'améliorer l'expérience utilisateur
- Proposer des évolutions logicielles pour Shanoir
- Contribuer à une meilleure interopérabilité de Shanoir avec les infrastructures de données cliniques et génomiques
- Suivre les dernières avancées et les bonnes pratiques en imagerie médicale et en gestion de données.

Compétences

Connaissances

- Maîtrise du développement logiciel dans environnement Linux
- Maîtrise d'un langage de programmation parmi Python, Java
- Connaissance des technologies du Web et des bases de données
- Une connaissance des logiciels et outils d'imagerie médicale (PACS) et des visualiseurs d'images médicales serait un avantage
- Méthodologies de gestion de projet
- Anglais technique
- Intérêt pour les sciences de la vie et la médecine

Savoir-Faire

- Concevoir et développer un logiciel
- Utiliser les outils de développement collaboratif et d'intégration continue
- Rédiger des documents techniques

Présenter des résultats en Français et en Anglais

Avantages

- Restauration subventionnée
- Transports publics remboursés partiellement
- Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
- Possibilité de télétravail et aménagement du temps de travail
- Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
- Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des oeuvres sociales d'Inria)
- Accès à la formation professionnelle
- Sécurité sociale

Rémunération

- Selon expérience profesionnelle