Ingénieur d'Études en Immunologie et Bio Informatique H/F - Ministère de l'enseignement supérieur et de la recherche

RÉSUMÉ DU POSTE
Analyser des jeux de données RNAseq et RNAseq de cellules uniques.
Choisir, adapter et mettre en oeuvre les protocoles de préparation et d'analyse des échantillons
biologiques dans le cadre d'un ou plusieurs domaines d'études : immunohistochimie, biologie
moléculaire, biologie cellulaire et biochimie.
Choisir, adapter et mettre en oeuvre des analyses cellulaires par immunohistochimie et/ ou par
immunofluorescence, et/ ou des analyses par des techniques d'étude d'expression géniques ou
protéiques. Une partie de ces analyses requiert des analyses d'image utilisant des logiciels spécifiques.
Tenir à jour les protocoles expérimentaux utilisés (cahiers et/ou traitements de texte).
Exploiter et présenter les résultats des analyses en réunion de laboratoire et en garantir la qualité.
Participer au bon fonctionnement de l'équipe de recherche en coordination avec les autres
membres du laboratoire (suivi du matériel et des réactifs, participation aux commandes...

DESCRIPTIF DES ACTIVITÉS
La personne recrutée travaillera sera sous la direction de Diane Damotte et de Lubka Roumenina et
sera amenée à travailler avec les différents chercheurs de l'équipe sur l'étude des maladies
inflammatoires rénales, hématologiques ou tumorales (analyse du microenvironnement immunitaire
tumoral) par des techniques d'immunohistochimie multiplex. L'ingénieur effectuera des analyses de
jeux de données RNAseq générés au laboratoire et analysera des jeux de données publique de
scRNAseq pour confronter l'expression de l'ARNr avec les résultats obtenus par marquage des tissus.
La personne participera également à la mise en place de panels pour l'imagerie multiplex à très haut
débit pour la technologie innovante de Comet (40-plex). L'ingénieur d'études participera également à
la mise en place et réaliser des modèles expérimentaux des maladies inflammatoires et de cancers afin
de mieux comprendre les mécanismes impliqués dans leur physiopathologie.

PROFIL RECHERCHÉ
Connaissances
- Bioinformatique, Analyses RNAseq et scRNAseq
- Techniques d'immunohistochimie
- Culture cellulaire
- Règles d'hygiène et sécurité en laboratoire.
- Rendre compte des observations et/ou des mesures faites dans le cadre d'un protocole
- Utiliser les logiciels courants : word, excel, power point, prism

Savoir-faire - Compétences opérationnelles
Travailler en équipe
- Communiquer ses résultats au sein du laboratoire
- Connaissances de base d'anglais parlé et écrit
- Analyse des data RNAseq et scRNAseq
- Maitriser les techniques de culture cellulaire
- Maitriser les techniques de base de biologie moléculaire et cellulaire
- Maitriser les techniques de base de biochimie