Ingénieur de Recherche en Bio Informatique - Dr - Laboratoire Gbcm H/F - Conservatoire National des Arts et Métiers (CNAM)

Le poste est rattaché à la Direction de la recheche au sein du Laboratoire Génomique Bioinformatique Chimie Moléculaire (GBCM) qui développe des recherches en génomique, bioinformatique structurale et chimie moléculaire pour comprendre les mécanismes moléculaires des maladies humaines et développer de nouvelles approches de diagnostic, de traitement, ou de prévention.Faire avancer les projets de recherche en bioinformatique du Laboratoire sous la direction du Directeur du Laboratoire, et travailler en particulier sur le projet de transcriptomique Chikgene, projet ANR, obtenu par le Laboratoire. De manière générale, ces projets portent notamment sur l'analyse de données omics de populations humaines malades et non malades avec le développement de nouveaux outils bioinformatiques d'exploitation de ces données et sur l'exploitation de ces données pour répondre aux problématiques biologiques et biomédicales posées au Laboratoire. Dans le cadre du projet Chikgene les données à traiter sont des données RNAseq de patients et de contrôles et des données de séquençage low coverage 4X.

· Niveau d'études min souhaité: Bac +5 au minimum, un doctorat dans le domaine serait très apprécié.

· Bonne connaissance de la biologie et de la physiopathogenèse des maladies.

· Domaine / Spécialisation: Biologie / Bioinformatique

· Niveau d'expérience minimum requise: 6 ans d'expérience post-Master 2, ou 3 ans post-doctorat souhaités.

Compétence attendues:

Connaissances
- Biologie générale, Immunologie, Biologie moléculaire, Génétique des populations, R, statistiques, imputation.

- Adaptabilité pour utiliser les logiciels de traitement de données omics comme : DESeq2, Metascape, DisgeNET, WGCNA, PLINK, SNPTEST, GSEA, Impute 2, Shape-IT, Predixcan, LDSC.

Savoir-faire
- Bioinformatique et traitement des données omics (ADN, ARN, réponse humorale).

Savoir-être

- Rigueur, aptitude au travail d'équipe, dynamisme, capacité à interagir avec d'autres experts

Outils

- Logiciels d'analyse des données omics (transcriptomique notamment)