Ingénieur·e en Imagerie et IA pour la Santé - H/F - Inserm

Notre équipe au sein du GIN « Neuroimagerie fonctionnelle et perfusion cérébrale » travaille au développement de techniques innovantes d'acquisition et d'analyse en imagerie et spectroscopie par Résonance Magnétique Nucléaire (IRM et SRM) et sur leurs applications précliniques et cliniques en neurosciences ().

Depuis plusieurs années, les développements en IA sont pleinement intégrés à nos travaux de recherche avec toute une part de l'équipe travaillant dans ce domaine. Nous recrutons donc pour renforcer l'équipe travaillant sur le neurodéveloppement de l'enfant, à l'intersection entre épidémiologie et neuroimagerie.

Mission principale

Vous travaillerez sur un projet dont 'objectif est de chercher des associations entre images IRM d'enfants d'une cohorte épidémiologique mère-enfant et l'exposition à certains polluants chimiques.

L'objectif de votre travail est de développer des modèles d'IA pour réduire la dimensionnalité des données (IRM et socio-démographiques) afin de mettre en évidence des associations avec des polluants.

Activités

principales

· Vous ferez un état de la bibliographie sur les méthodes de réduction de dimensions par des outils d'IA pour intégrer des données multimodales issues d'images IRM et de variables socio-démographiques

· Vous développerez et comparerez des architectures d'IA avec cross-validation sur des données test et validation'

· Vous réaliserez les analyses statistiques dans l'espace latent pour explorer les liens avec les polluants chimiques

· Vous créerez les notebooks correspondants pour assurer la traçabilité de vos analyses

· Vous documenterez les résultats

· Vous diffuserez vos programmes en open-source

· Vous présenterez vos travaux (en local et/ou en conférences)

· Vous pourrez suivre certaines formations en li...

Connaissances

- Méthodes statistiques appliquées à l'analyse de données

- Outils de réduction de dimensions basés sur l'IA

- Des connaissances de base en IRM et en logiciels de neuroimagerie (SPM, VolBrain, BrainVisa, FreeSurfer, FSL, etc.) seraient un plus

Savoir-faire

- Programmation logicielle en Python, Matlab et/ou R

- Utilisation d'environnements Linux et de serveurs distants (bash shell, etc.)

- Maîtrise de PyTorch ou d'un framework équivalent

- Maîtrise d'outils de traçabilité et de reproductibilité (notebooks, documentation du code)

Apt...