Ingenieur·e de Recherche en Bioinformatique - Istct H/F - Université de Caen Basse-Normandie

Présentation de l'unité de recherche :

L'unité ISTCT « Imagerie et Stratégies Thérapeutiques pour les Cancers et Tissus Cérébraux », UMR6030 est une unité mixte de recherche du CNRS et de l'Université de Caen-Normandie (UNICAEN) hébergée au GIP CYCERON à Caen.

Les activités de recherche d'ISTCT visent à mieux comprendre la physiopathologie des tumeurs hypoxiques (cerveau-poumon) et identifier de nouvelles stratégies thérapeutiques ciblant la tumeur et son microenvironnement mais aussi à protéger le tissu sain environnant des traitements anti-cancéreux tels que la radiothérapie.Positionnement hiérarchique :

Sous la responsabilité du Dr Aurélien JUSTET, MCU-PH (n+1) et la direction unité (Dir. Myriam BERNAUDIN, Dir Adj. Samuel VALABLE).

Missions :

Dans le cadre des activités de recherche du projet SOMAFIBRAD porté par A. JUSTET au sein de lunité ISTCT, le/la bioinformaticien(ne) participera à un projet visant à analyser et intégrer des données transcriptomique et génomique en vue d'identifier les mutations somatiques associées à l'existences de populations cellulaires impliquées dqns la fibrogenèse pulmonaire.

Activités principales du poste :

- Définition et mise en oeuvre le protocole d'analyse de données biologiques : traitement, nettoyage et normalisation de données issues d'analyse transcriptomique à noyaux unique
- Identification de mutations somatiques à partir du pipeline GATK mise en place par le broadInstitute
- Développement de pipelines reproductibles : création et maintenance de workflows d'analyse sous R/Python
- Interaction avec l'équipe-projet : échanges réguliers avec biologistes, cliniciens et biostatisticiens ; participation aux réunions de projet et des collaborateurs internationaux (Yale University,Univeriste d' Hannovre)
- Diffusion et valorisation des résultats et réalisations technologiques sous forme de communication scientifique et préparation de figures, rapports, documentation, contributions aux publications.
- Gestion des données : organisation, documentation et archivage des données selon les bonnes pratiques en recherche (PGD, FAIR, traçabilité).
- Veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité
- Formation, en interne (ex Doctorants, post-doctorants) et en externe, aux principes et à la mise en oeuvre des techniques citées précédemment.

Catégorie d'emploi:A

Diplôme requis :

Diplôme d'ingénieur, Doctorat

Formation solide en bioinformatique, biostatistiques, data science ou équivalent

Compétences attendues:

Connaissances:

- Bioinformatique, biostatistiques, analyse de données omiques.
Connaissances solides en R et/ou Python (ou autre langage de programmation)
- Notions avancées en cytométrie en flux ou en protéomique (au moins l'un des deux ; idéalement les deux).
- Connaissances en méthodes d'intégration de données multi-omics.
- Compréhension générale de la biologie des systèmes, immunologie ou cancérologie (apprécié).
- Connaissance des principes FAIR et des bonnes pratiques de gestion des données

Compétences opérationnelles:

- Concevoir, traiter et analyser des données multiparamétriques volumineuses
- Construire et documenter des pipelines d'analyse reproductibles
- Mettre en oeuvre des analyses statistiques avancées
- Visualiser et présenter clairement des résultats complexes
- Rédiger des méthodologies, des rapports et des documents techniques
- Travailler en équipe

Compétences comportementales:

- Rigueur scientifique
- Capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire
- Autonomie dans la gestion des projets d'analyse
- Esprit analytique, capacités de synthèse
- Qualités relationnelles
- Organisation et gestion de projets
- Capacité d'adaptation
- Capacité à anticiper et résoudre les problèmes
- Bonnes compétences de communication orale et écrite

Conditions de recrutement :

Recrutement sur contrat de recherche, sous réserve de la disponibilité du financement.

Poste à temps complet, ouvert uniquement aux contractuels (CDD).

Rémunération statutaire et appréciée en fonction de l'expérience professionnelle.

A compétences égales, priorité aux travailleurs handicapés et aux autres bénéficiaires de l'obligation d'emploi.

Poste à pourvoir : 1er avril 2026 au 30 juin 2027, renouvelable.

Date limite de candidature : 01/03/2026

Si vous êtes intéressé par cette offre, vous pouvez candidater uniquement sur notre site dédié https://recrutement-unicaen.nousrecrutons.fr/. Les candidatures reçues en dehors de ce canal ne seront pas étudiées