Chercheur en Génétique et Biologie H/F - Institut de Recherche pour le Développement (IRD)

est un laboratoire de recherche spécialisé dans la biodiversité, l'adaptation et le développement des plantes tropicales. Il est situé au centre Occitanie de l'IRD, dans la magnifique ville de Montpellier, en Occitanie, près de la Méditerranée. Unité mixte IRD-CIRAD-Université de Montpellier, il regroupe sept équipes.

Vous intégrerez l'équipe qui, outre d'autres questions scientifiques liées à la reproduction végétale, étudie les bases génétiques et moléculaires de la stérilité hybride interspécifique chez le riz (Oryza spp.) et recherche des solutions pour surmonter cette barrière reproductive par des approches conventionnelles et d'édition du génome. Ce travail sera mené en étroite collaboration avec l'équipe

Cette recherche s'inscrit dans un effort plus vaste visant à comprendre les barrières reproductives et leur impact sur la diversité génétique, la spéciation et l'amélioration des cultures pour une agriculture durable. Ce projet bénéficie d'un financement important et du soutien du projet phare DIVEDIT (Promotion de l'agro-biodiversité par l'édition du génome, 2023-2029) dans le cadre du Programme national d'amélioration des plantes (PEPR)

Une mission attractive

Sous la responsabilité d'un directeur de recherche à l'IRD, et avec le soutien de plusieurs chercheurs impliqués dans le projet DIVEDIT, votre mission consistera à étudier l'architecture génétique et les mécanismes moléculaires sous-jacents à la stérilité hybride entre les espèces de riz cultivées africaine (Oryza glaberrima) et asiatique (Oryza sativa), et à développer des approches d'édition génomique pour obtenir des hybrides interspécifiques fertiles.

Le projet intègre plusieurs approches complémentaires: génétique moléculaire et génomique; génomique fonctionnelle, incluant l'édition génomique; caractérisation phénotypique et cytologique des caractères liés à la stérilité. L'objectif final est de déterminer si la modification de locus-clés liés à la stérilité permet de mieux comprendre et de surmonter les mécanismes d'isolement reproductif entre les deux espèces de riz.

Vos activités seront les suivantes:

- Concevoir et réaliser des croisements génétiques et des expériences de marqueurs moléculaires.
- Analyser des jeux de données génomiques à l'aide d'outils bio-informatiques.
- Concevoir des approches d'édition du génome pour contrer l'effet létal des gènes de stérilité sur les gamètes.
- Réaliser l'imagerie des cellules de gamétophytes par microscopie optique.
- Préparer des articles pour des revues à comité de lecture et présenter les résultats lors de congrès scientifiques.

Votre future équipe

Vous intégrerez l'équipe REPROD, composée de onze membres permanents. Cette équipe réunit des compétences pointues en génétique, génomique, génomique fonctionnelle et microscopie. Vous travaillerez en étroite collaboration avec l'équipe CERES, experte en édition du génome du riz et en phénotypage.

Les deux équipes évoluent au sein d'un réseau collaboratif de partenaires nationaux et internationaux, offrant:

- Un environnement de recherche stimulant à l'IRD Montpellier, au sein d'un réseau collaboratif de partenaires nationaux et internationaux.
- L'accès à des plateformes de pointe en génomique, microscopie et phénotypage.

Vous avez développé les compétences suivantes :

- Solides connaissances en génomique des populations et en génétique statistique.
- Expertise en génétique et/ou génomique végétale.
Formation aux techniques moléculaires (p. ex., CRISPR/Cas9, RNA-seq, qPCR) et à la génétique statistique.
- Intérêt pour le développement de la reproduction végétale et les outils d'observation associés.
Compétences en analyses démographiques/phylogéographiques.
- Compétences en bio-informatique et en programmation.
- Aptitudes d'analyse et de communication.
- Anglais niveau C1.ilisation des outils de versionnage de code (git, gitlab, github).

Vous savez comment :

- Concevoir et analyser des expériences génétiques impliquant l'analyse de ségrégation mendélienne.
- Concevoir et interpréter des expériences d'édition du génome (ARN guides, transformation, expression génique)
- Préparer et observer des échantillons pour la microscopie.

Vous faites preuves des qualités humaines suivantes

- Autonomie.
- Curiosité intellectuelle.
- Capacité d'adaptation et de conceptualisation.
- Rigueur / fiabilité.Sens critique.
- Qualités relationnelles.

Vous êtes titulaire d'un doctorat (niveau 8) en génétique, en sciences moléculaires végétales, en biotechnologie végétale ou dans un domaine connexe, et vous justifiez d'une expérience professionnelle d'au maximum deux ans après l'obtention de votre doctorat.