Ingénieur Bioinformatique - Ngs Pipelines H/F - LEA

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LEA Recrutement présente une nouvelle offre d'emploi : CDI chez client final.

Notre client, acteur innovant de la bio-informatique basé à Montpellier, recrute un Ingénieur Bioinformatique - NGS pipelines H/F afin de concevoir et industrialiser des pipelines d'analyse génomique à grande échelle.

Compétences recherchées

Votre rôle et missions :

- Concevoir et maintenir des pipelines bioinformatiques de production (FASTQ, BAM, VCF)
- Industrialiser les workflows d'analyse et améliorer leur robustesse et leur performance.
- Développer les composants backend permettant l'orchestration et l'exécution distribuée des analyses.
- Mettre en place des outils de validation, de test et d'automatisation des pipelines.
- Améliorer l'observabilité des systèmes (logs, métriques, monitoring)
- Collaborer avec les équipes bioinformatique, data et infrastructure.

Ce que nous attendons de vous :

- Formation en bioinformatique, informatique ou domaine scientifique connexe.
- Expérience en pipelines NGS et formats de données génomiques (FASTQ, BAM, VCF)
- Maîtrise d'outils de workflow bioinformatique (Nextflow ou équivalent)
- Expérience en développement backend (API, orchestration, traitement asynchrone)
- Bonnes pratiques d'ingénierie logicielle : tests, CI/CD, optimisation et fiabilité.
- Bonne compréhension des bases de données et de l'optimisation des performances.
- Rigueur scientifique, autonomie et capacité à travailler dans un environnement multidisciplinaire.

Les avantages côté entreprise :

- Avantages à découvrir !
- Projets à forte valeur scientifique et technique.

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