Thèse Comprendre Revisiter et Contrôler la Signalisation Lyn dans les Macrophages par Optogénétique. H/F - Université Grenoble Alpes

Établissement : Université Grenoble Alpes
École doctorale : CSV- Chimie et Sciences du Vivant
Laboratoire de recherche : IAB : Institute for Advanced Biosciences (UGA / Inserm U1209 / CNRS UMR 5309)
Direction de la thèse : Olivier DESTAING ORCID 0000000176223700
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-04-09T23:59:59

La fonction principale de la signalisation cellulaire est d'intégrer la complexité de l'environnement extracellulaire (matrice extracellulaire,
contact cellule-cellule, paramètres physiques, facteurs solubles...) pour induire des événements décisionnels spécifiques et divers, générant des réponses cellulaires adaptées.
Le nouveau défi de la signalisation cellulaire est de comprendre la forte pléiotropie d'un relais de signalisation qui peut à la fois être activé par des récepteurs très divers et générer des réponses cellulaires très distinctes. Cela suppose que chaque relais de signalisation peut générer des événements décisionnels de signalisation différents et adaptés, conduisant à des réponses cellulaires adaptées. Cela est particulièrement importnat pour comprendre les multiples fonctions des macrophages. De plus, cela est essentiel pour développer de nouvelles biotechnologies et immunothérapies centrées sur les macrophages.
Comme exemple canonique de relais de signalisation pléiotrope, nous avons proposé de nous concentrer sur les kinases de la famille Src (SFK) et en particulier la kinase LYN. Nos travaux sur les kinases SRC et HCK ont apporté des connaissances fortement originales sur la biologie des macrophages et leurs fonctions invasives. En effet, les macrophages peuvent exprimer jusqu'à 6 membres des SFK, et leurs fonctions précises et leur diversité n'ont jamais été élucidées.
Les modèles génétiques de souris soutiennent l'idée
qu'il existe un niveau élevé de redondance fonctionnelle entre les membres de la SFK. Pour contrer cette apparente redondance, nous avons montré que nos sondes optogénétiques permettaient d'avoir accès à la spécificité de chaque membre de cette famille. Nous proposons donc d'étudier les fonctions spécifiques de la kinase LYN via cette méthode. Pour cela, nous déterminerons les conséquences moléculaires des différents
événements décisionnels en identifiant les complexes biochimiques spécifiques associés à l'activation de notre optoLYN et leurs substrats de
phosphorylation spécifiques. Grâce à l'analyse multidimensionnelle des réseaux biologiques, nous modéliserons ensuite la manière dont
les complexes biochimiques formés conduisent à différents événements décisionnels par le biais de réseaux d'interactions protéine-
protéine (ppin). Cela nous permettra d'étudier la propagation du signal LYN contrôlé dans les réseaux de signalisation en aval.

Ce doctorat sera réalisé à l'IAB de Grenoble, au sein de l'équipe INVADE co-dirigé par E. Faurobert et Olivier DESTAING. Ce travail s'inscrira dans le cadre de
collaborations nationales avec le Dr C. Brun du TAGC-Marseille, le Dr D. Bourgeois de l'IBS-Grenoble, le Dr Vassilopoulos (Paris), et sera ouvert à des collaborations internationales (États-Unis, Suisse, Sinagpoure et Canada). L'étudiant bénéficiera de notre collaboration avec le
centre de protéomique EDyP du CEA Grenoble et du centre de microscopie de l'IAB (MicroCell).

Comprendre les fonctions spécifiques de la kinase LYN grâce à une nouvelle méthode d'optogénétique pour comprendre la globalité de cette signalisaiton dans les macrophages.

Culture cellulaire
Microscopie confocale
Multi-omique (metabolomique, protéomique, phosphoprotéomique, lipidomique, transcriptomique)
Live imaging
Optogénétique
Biologie moléculaire

Grande culture en biologie cellulaire
Biochimiste
Biologiste cellulaire
Approche interdisciplinaire
Des notions de traitement d'image et/ou de codage seront appréciés.

Travail en équipe, envie de partager, ponctualité, CURIOSITE