Thèse Interaction Lipoprotéines O-Glycosylées Bifides et Système Immunitaire Comme Support de l'Activité Anti-Coxsackievirus B4 H/F - Doctorat_Gouv

Établissement : Université de Lille
École doctorale : Biologie Santé de Lille
Laboratoire de recherche : Pathogenèse virale
Direction de la thèse : Philippe GERVOIS ORCID 000000033709957X
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-04-28T23:59:59

La découverte récente du passage de la sphère intestinale à la moelle osseuse de lipoprotéines bifides et leur capture par les cellules plasmacytoides (pCDs) ouvrent des perspectives anti-virales plus vastes que celles déjà connues dans le cas de la neutralisation anticoxsakievirus. Les pDCs interviennent en première ligne lors d'une infection en sécrétant l'interféron alpha. Le projet de la présente thèse est de disséquer les différentes étapes allant du passage à travers la paroi intestinale à la capture par les cellules plasmacytoides, leur activation potentielle (production d'IFN-alpha) et l'effet anti-viral en résultant (modèles coxsackievirus B4/rhinovirus). Cette étude approfondie permettra de cibler les applications et d'anticiper les effets indésirables en fonction des doses.

Le projet de thèse s'inscrit dans la thématique « Santé de précision et maladies civilisationnelles » par son caractère exploratoire des interactions lipoprotéines bifides et cellules plasmacytoides. La possibilité de réguler des cellules de l'immunité anti-virale par des molécules microbiennes issues de bactéries du microbiome ouvre des perspectives non seulement de prévention de maladies civilisationnelles comme le diabète mais également de thérapeutiques dédiées à réduire les effets délétères lors d'infections initiatrices de maladies chroniques (diabète de type 1 et coxsackievirus).
La preuve de concept apportée par les travaux de thèse permettra un transfert vers le contrôle d'autres agents viraux entériques dans une approche « Une seule santé ».

L'objectif principal est de décrire la modulation du système immunitaire inné par les lipoprotéines bifides et leur impact dans la prévention de l'infection, en particulier par CV B. Des approches cellulaires seront utilisées pour mimer (i) l'environnement intestinal : zone de passage des lipoprotéines, induction de la tolérance, et infection par CV B4, (ii) le système immunitaire systémique, en se focalisant sur les cellules plasmacytoides.

Les cellules plasmacytoides étant faiblement présentes dans le sang humain, les études de reconnaissance lipoprotéines/récepteurs seront effectuées à l'aide de cellules transformées présentant des récepteurs potentiellement impliqués (ex : CHO ldl-A7 pour LDLr2 et
TLRs, Cos-1 cell for le récepteur de l'asialoglycoprotein...). Les lipoprotéines seront en partie dé-glycosylées pour confirmer l'influence des sucres dans les reconnaissances et marquées pour une détection plus sensible. Enfin, l'implication des récepteurs sera confirmée au niveau de populations de pCDs isolées de sang en présence d'anticorps. CV B4 infecte les cellules Caco2 via le récepteur CAR. Par ailleurs, les lipoprotéines bifides traversent les lits de cellules Caco2 et peuvent s'adsorber sur les CV B4. Il peut s'ensuivre une compétition entre les deux phénomènes réduisant ainsi la capacité de passage des lipoprotéines vers les cellules plasmacytoides. Aussi, une première approche consistera à quantifier les ratios entre particules virales et lipoprotéines bifides prévenant l'infection tout en vérifiant la transcytose (en présence et absence d'inhibiteurs de l'endocytose comme amantadine HCl, Chlorpromazine HCl, Methylbeta cyclodextrin, Nystatin, filipin III, genistein..) des lipoprotéines (libres ou liées aux CV B4) avec un suivi des réponses locales pro/anti-inflammatoires.

Capacité de conception de projet et de rédaction scientifique. Analyse des publications. Compétences en biologie cellulaire (culture cellulaire) et moléculaire( analyse de l'expression des gènes) et biochimie (méthodes d'électrophorèse et méthodes d'extraction et de purification).