Thèse Développement de Pan-Inhibiteurs des Protéases 3Cl Agents Antiviraux Contre la Famille des Coronavirus H/F - Université de Lille

Établissement : Université de Lille
École doctorale : Biologie Santé de Lille
Laboratoire de recherche : Médicaments et Molécules pour Agir sur les Systèmes Vivants
Direction de la thèse : Julie CHARTON ORCID 000000016895276X
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-04-28T23:59:59

Le projet de thèse s'inscrit dans un projet de développement d'un candidat antiviral préclinique contre les virus de la famille des coronavirus, famille de plus en plus souvent en cause dans les maladies virales émergentes à l'origine de pandémies (SARS-CoV, MERS-CoV, SARS-CoV-2). Le projet vise à optimiser des composés antiviraux ciblant la protéase virale 3CLpro afin d'identifier une arme thérapeutique pour le traitement de la COVID-19 mais aussi contre les potentiels coronavirus émergents. La protéase 3CL (3CLpro, MPro), protéase très conservée au sein de la famille des coronavirus, est un constituant essentiel du cycle viral. L'autorisation de mise sur le marché d'inhibiteurs de la 3CLpro a confirmé l'intérêt de cette protéase virale comme cible thérapeutique. Différentes stratégies de criblage ont permis l'identification de plusieurs séries chimiques d'intérêt. Une première phase d'optimisation a eu lieu et a permis de sélectionner une série chimique présentant une puissante activité antivirale contre le SARS-CoV-2 et ses variants mais dont la largeur du spectre d'action sur les autres coronavirus humains et les propriétés pharmacocinétiques restent à améliorer. L'objectif du projet de thèse consistera, grâce aux outils de la chimie médicinale, en l'optimisation multiparamétrique de cette série chimique afin d'identifier un candidat préclinique anti-coronavirus à large spectre.

Le sujet de thèse s'inscrit dans un projet qui a démarré dès le début de la crise sanitaire en 2020 et ayant pour objectif le développement d'un candidat médicament antiviral à large spectre contre la famille des coronavirus, de plus en plus souvent en cause dans les pandémies virales émergentes. Dans ce contexte, nous nous focalisons sur le développement de composés ciblant la protéase 3CL, un constituant essentiel du cycle de réplication de ces virus. A la suite de différentes stratégies de criblage et d'une première phase d'optimisation, une série chimique présentant une puissante activité antivirale contre le SARS-CoV-2 et ses variants a été identifiée. Le travail de thèse s'inscrira alors dans l'optimisation des propriétés pharmacocinétique et du spectre d'action sur différents coronavirus afin d'identifier un candidat pré-clinique au sein de cette série chimique.

Le candidat devra posséder un Master 2 en chimie organique ou chimie médicinale et être issu de faculté de sciences, de pharmacie ou d'école d'ingénieur chimiste. Le candidat utilisera les techniques et appareils suivants :
-chimie en phase homogène ou solide
- Synthèse multi-étapes
-techniques d'analyses (LCMS, HRMS, RMN 1H 13C, 1D, 2D)
-techniques de purification (chromatographie flash, HPLC préparative)
-outils de recherche bibliographique (Reaxys, SciFinder)
Afin d'avoir du succès dans cette recherche, le candidat devra faire preuve de rigueur, créativité, initiative et capacité à travailler en équipe.