Ingénieur·e d'Étude en Bioinformatique H/F - Nantes Université

Le CR2TI est une Unité Mixte de Recherche de l'Inserm et de Nantes Université basée sur le campus du CHU de Nantes et le bâtiment IRS2. Il est constitué de 6 équipes de recherche pour un total de 230 personnes (chercheurs, enseignants-chercheurs, cliniciens, étudiants, ingénieurs, techniciens) principalement dédiées au décryptage des mécanismes immunologiques et à l'amélioration du diagnostic et des traitements dans les domaines de la transplantation d'organes, des maladies inflammatoires, auto-immunes et des maladies infectieuses.

Le projet du poste proposé s'inscrit dans un programme de recherche international, multicentrique ANR NeoTraid (Neonatal Treg in autoimmune diseases), coordonné par le Dr Cédric Auffray à l'Institut Cochin, Paris, en collaboration avec le Dr Benoit Salomon (Infinity, Toulouse) et le Dr Matthieu Giraud (CR2TI, Nantes).

L'objectif général de ce projet est d'étudier l'impact des lymphocytes T régulateurs néonataux (nnTregs) dans le contrôle des maladies auto-immunes chez la souris, en portant une attention particulière au rôle du facteur de transcription Foxo1 dans leur génération et aux moyens de moduler les nnTreg par des micro-organismes.

Le/la bioinformaticien-ne recruté-e travaillera spécifiquement sur la dissection des programmes transcriptionnels et épigénétiques contrôlés par Foxo1 dans le développement des lymphocytes T régulateurs thymiques (tTregs).

Activités principales

· Activité 1 : Analyse de données transcriptomiques et épigénétiques

· Activité 2 : Analyses bio-informatiques avancées

· Activité 3 : Valorisation et collaboration

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- Formation et/ou qualification : Master 2 en Bioinformatique ou Doctorat en Bioinformatique / Biologie computationnelle

- Expériences requisesen analyse de données transcriptomiques (RNA-seq, scRNA-seq) et en analyse de données épigénétiques (ATAC-seq, ChIP-seq)

- Expériences antérieures bienvenues pour occuper le poste : minimum 2 ans d'expérience sur des projets en immunologie