Alternance Ingénieur en Biotechnologies - Bioproduction H/F - Ifremer

Rejoignez l'Ifremer pour un océan mieux compris, mieux protégé qui demeure un allié du bien-vivre sur la planète

Des abysses à la surface, de la côte au large, l'Ifremer est l'institut de recherche français entièrement dédié à l'Océan. Ses équipes mènent des recherches, innovent et produisent des expertises pour protéger l'océan, exploiter ses ressources de manière responsable et partager les données marines.

L'Ifremer apporte son expertise scientifique pour éclairer les politiques publiques et élabore des solutions puisées dans l'océan pour répondre aux enjeux de la transition écologique. Opérateur de la Flotte océanographique française avec sa filiale d'armement Genavir, l'Ifremer imagine, conçoit et déploie des moyens technologiques de pointe pour percer les mystères de l'océan.

Rejoignez nos équipes, composées de 1500 scientifiques et métiers supports à la recherche, et présentes sur tout le littoral métropolitain et en Outre-mer.

www.ifremer.fr

Date limite de dépôt des candidatures : 30/04/2026

Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer, l'Ifremer contribue, par ses travaux et expertises, à la connaissance des océans et de leurs ressources, à la surveillance du milieu marin et littoral et au développement durable des activités maritimes. L'Ifremer est source de connaissances, d'innovation, de données de surveillance et d'expertise pour le monde de la mer, à la fois en matière de politique publique et d'activité socio-économique. Il est la seule structure de ce type en Europe.

Fondé en 1984, l'Ifremer est un établissement public à caractère industriel et commercial (EPIC), placé sous la tutelle conjointe du ministère de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Innovation, et du ministère de la Transition écologique et solidaire.

Présentation de la structure d'accueil :

L'unité « Physiologie et Toxines des Microalgues Toxiques et Nuisibles » (PHYTOX) est localisée sur le site de Nantes du Centre Atlantique de l'Ifremer. Cette unité, qui a vu le jour le 01/01/22, est structurée en 3 laboratoires fonctionnels :

- Laboratoire PHYSiologie des micro ALGues (PHYSALG), qui vise à caractériser les réponses physiologiques des Microalgues Toxiques et Nuisibles face à leur environnement
- Laboratoire GENomique des microALGues (GENALG), qui vise à comprendre les mécanismes moléculaires impliqués dans le succès écologique des Microalgues Toxiques et Nuisibles
- Laboratoire METabolites des microALGues (METALG), pour l'étude des métabolites algaux, leurs biotransformations et diversité

L'activité de PHYTOX se décline en 3 axes de recherche transversaux à ces 3 laboratoires :

- Les mécanismes physiologiques et les stratégies trophiques des microalgues toxiques et nuisibles
- L'écologie chimique : rôle des toxines et autres métabolites algaux dans les interactions biotiques
- Les risques actuels et les émergences toxiniques : bio- et chimiodiversité à travers les écosystèmes

Les principaux objectifs de l'unité de recherche PHYTOX sont de comprendre les mécanismes physiologiques et moléculaires impliqués dans le succès écologique des algues nuisibles, la structure des toxines émergentes et nouvelles, ainsi que les fonctions écologiques et les impacts des microalgues toxiques.

Pour cela, les réponses de ces microalgues aux facteurs environnementaux, leurs stratégies trophiques et leurs interactions avec d'autres microorganismes et animaux marins sont étudiées dans des conditions contrôlées.

Une attention particulière est accordée aux toxines de ces microalgues, à leur diversité chimique, à leur devenir dans les réseaux alimentaires marins et à leur rôle dans la physiologie cellulaire et les interactions avec d'autres organismes.

Pour ce faire, le laboratoire collabore avec les partenaires concernés aux échelles régionale, nationale, européenne et internationale. L'Unité mène également des actions transversales d'appui aux politiques publiques et d'innovation.

Introduction du poste à pourvoir et de sa position dans l'organigramme

Au sein du département "Océanographie et Dynamique des Ecosystèmes" et de l'Unité PHYTOX, vous serez intégré(e) au laboratoire GENALG et placé(e) sous la responsabilité hiérarchique de son responsable.

L'alternance s'inscrit dans le cadre du projet VIBES, qui vise à étudier les vésicules extracellulaires (VEs) produites par les microalgues toxiques et leur rôle dans les interactions biotiques, en particulier dans les processus de mixotrophie et d'allélopathie.

Des travaux préliminaires menés au laboratoire ont mis en évidence la présence de VEs dans les cultures de microalgues toxiques. Par ailleurs, la détection de toxines dans des fractions enrichies en VEs suggère que ces composés pourraient être associées aux vésicules.

Ces résultats ouvrent la voie à l'hypothèse d'un nouveau mécanisme d'empaquetage et de transfert des toxines algales, médié par les VEs.

Dans ce contexte, l'objectif de l'alternance est d'évaluer l'existence d'un lien direct entre les VEs, les toxines et l'activité biologique des microalgues toxiques sur d'autres microalgues.

Quelles seront vos missions ?

Votre mission consistera à produire des fractions enrichies en VEs en vue de leur caractérisation moléculaire et fonctionnelle.

Quelles seront vos activités ?

Votre activité portera sur :

- la production et l'isolement de fractions enrichies en VEs de différentes cultures de microalgues
- l'optimisation du protocole de purification des VEs (gradient de densité, SEC...)
- la réalisation de bioessais pour évaluer l'activité lytique (par cytométrie en flux).

Avec qui allez-vous travailler ?

- En interne : vous serez encadré(e) par le personnel de l'unité PHYTOX participant au projet VIBES
- En externe : vous collaborerez avec les partenaires du projet VIBES

Comment se déroulera votre activité ?

Le taux d'activité sera de 100%

Pas de déplacement

Pas de télétravail

Qui êtes-vous ?

Dernier diplôme :

- Master 1 ou équivalent

Diplôme en alternance visé :

- Master 2 ou Ingénieur

Vous cherchez un contrat d'alternance en apprentissage ou en contrat de professionnalisation d'une durée de 1 an

Vous avez les compétences, connaissances et expériences suivantes :

- Microbiologie
- Optimisation de bioprocédés (établir une démarche scientifique et expérimentale, optimiser un bioprocédé mettant en oeuvre des biotechnologies)
- Cytométrie en flux
- Gestion de projet (établir un plan d'action, analyser des problématiques complexes et anticiper les problèmes liés à leur résolution)
- Anglais scientifique
- Synthèse bibliographique
- Rédaction de rapports
- Maîtrise des outils de communication professionnelle
- Transmettre, diffuser des informations scientifiques et des connaissances

Vous avez les qualités suivantes :

- Esprit d'initiative, autonomie
- Rigueur dans la programmation et la mise en oeuvre des protocoles
- Aptitude à travailler en équipe
- Qualités rédactionnelles
- Dynamisme, curiosité