Thèse Axe Intestin-Cerveau et la Santé Mentale Rôle des Métabolites Microbiens dans la Santé Mentale H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Bordeaux
École doctorale : Sciences de la Vie et de la Santé
Laboratoire de recherche : Nutrition et Neurobiologie Intégrée
Direction de la thèse : Sophie LAYé ORCID 0000000238431012
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-05-20T23:59:59

Les études de l'axe intestin-cerveau dans les troubles cérébraux ont identifié le microbiote intestinal comme un acteur crucial dans l'apparition et l'évolution de plusieurs processus neuropathologiques, en particulier les voies neuro-inflammatoires. Cependant, malgré de nombreuses études rapportant un déséquilibre dans la composition du microbiote, les mécanismes sous-jacents à ces processus restent mal compris. L'objectif de ce projet de thèse est d'étudier le rôle des métabolites dérivés du microbiote dans les processus neuro-inflammatoires et de déterminer si des interventions diététiques peuvent améliorer ces altérations. Cette recherche utilisera une approche intégrative.

Understanding the role of gut microbiota-derived metabolites in brain disorders and neuroinflammation is crucial for advancing the knowledge of neurological health and developing new therapeutic approaches. The gut microbiota produces a wide range of metabolites that can influence brain function through the gut-brain axis. These metabolites, including short-chain fatty acids, amino acid metabolites, and secondary bile acids, play significant roles in modulating neuroinflammation, blood-brain barrier integrity, and neurotransmitter production. Recent research has shown that alterations in gut microbiota composition and their metabolites are associated with various neurological disorders, such as mental disorders or neurodegenerative diseases. The understanding of these connections aim to further develop targeted interventions to manipulate the gut microbiome and its metabolites for preventing and treating neurological diseases. In particular, nutritional approaches aiming to favor the production of neuroprotective microbiota-derived metabolites represent a potent strategy.

This project aims to determine the causal role of microbiota-derived metabolites in neuroinflammatory pathways, focusing on aberrant microglia-neuron interactions using a multidisciplinary approach that spans from in vivo to in vitro models.

First, using several models of stress, a thorough analysis of gut health, microbiota composition, microbiota-derived metabolite profiles, neuroimmune interactions, and the measurement of emotional behavior and cognition will be performed. Subsequently, the consequences of transferring the microbiota from stressed mice to healthy mice will be analyzed on the same parameters to further correlate microbiota/metabolite changes with behavioral dimensions. Additionally, the role of microbiota-derived metabolites will be assessed using cell culture (neurons, microglia) and transgenic mice with impaired metabolite receptors in brain cells (microglia or neurons). Finally, dietary interventions will be implemented using nutrient mixes relevant to the neuroprotective microbiota-derived metabolites identified in previous experiments.

Le/la candidat(e) devra avoir une expérience forte en neurosciences et manifester un fort intérêt pour une recherche intégrée en neurosciences, associant approches comportementales et biologie cellulaire et moléculaire. Des compétences ou un intérêt marqué en nutrition sont souhaités, incluant l'étude du microbiote.