Thèse Contribution de la Polarisation des Macrophages dans les Infections Persistentes à Klebsiella Pneumoniae In Vivo H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Montpellier
École doctorale : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé
Laboratoire de recherche : LPHI - Laboratory of Pathogens and Host Immunity
Direction de la thèse : Mai NGUYEN CHI ORCID 0000000326722426
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-05-11T23:59:59

Klebsiella pneumoniae est l'un des agents pathogènes les plus mortels au monde, récemment considérée comme une 'menace urgente' par les organismes de santé du monde entier, et est l'un des six agents pathogènes du groupe ESKAPE responsables de la plupart des infections nosocomiales résistantes aux antibiotiques. Pourtant, malgré la quasi-impasse thérapeutique auxquelles les infections à Kp nous confrontent, la compréhension de sa pathogénie reste très modeste. Notre compréhension de la dynamique d'interaction entre Klebsiella pneumoniae et les macrophages in vivo reste très limitée.
Grace à leur transparence et leur génétiques, les larves de zebrafish représentent un modèle de choix pour comprendre les interaction hôte-pathogènes. Dans notre laboratoire, nous générons des lignées transgéniques avec des macrophages marqués par fluorescence afin de visualiser des macrophages activés. L'objectif principal de ce projet est développer un modèle d'infection à Klebsiella pneumoniae chez l'embryon de zebrafish pour déchiffrer les mécanismes régulateur de l'infections persistente chez l'hôte en se focalisant sur les macrophages activés et polarisés.
Le laboratoire possède une longue expérience des modèles d'infection chez le zebrafish et a récemment développé des outils transgéniques innovants pour étudier l'activation des cellules de l'immunité innée (Begon-Pescia et al. 2026. doi: 10.3389/fimmu.2025.1721612 ; Leiba et al 2024. doi: https://doi.org/10.7554/eLife.89828; Phan et al, 2018, DOI: 10.1371 / journal.ppat.1007157 ; Sipka et al 2023, doi:10.1016/j.freeradbiomed.2022.09.021).

Klebsiella pneumoniae (Kp) is one of the deadliest pathogens in the world, recently classified as an 'urgent threat' by health organizations worldwide. It is also one of the six ESKAPE pathogens responsible for most antibiotic-resistant nosocomial infections. However, despite the near-therapeutic deadlock posed by Kp infections, our understanding of its pathogenicity remains very limited. Classically perceived as exclusively extracellular, this bacterium has recently been observed inside macrophages and epithelial cells in vitro and in vivo. Once inside macrophages, it manipulates phagosome maturation, thereby establishing an intracellular niche for its survival. Beside this progress, our comprehension of the dynamic interaction between Klebsiella pneumoniae and macrophages in vivo remains highly restricted.
The mouse has been the primary model organism for studying the virulence of Kp, although simpler models have also been used. However, due to practical limitations such as the inability to analyze dynamic processes in real time in living host, the development of alternative models to mammals is urgently needed. The zebrafish is a promising model organism for immunological studies. A developmental window between the innate and adaptive immune systems allows for the investigation of mechanisms driven exclusively by innate immunity. Moreover, the zebrafish shares many similarities with the mammalian immune system and possesses counterparts for most human immune cells. The transparency of its larvae makes it particularly well-suited for real-time observation of immune cells and pathogens in vivo, establishing it as a model of choice for studying Kp infections in the host.

Il/elle devra être intéressé.e par le travail sur modèle animal, par la microscopie, par l'analyse d'image, et faire preuve d'un intérêt pour l'immunologie et la microbiologie. Autres compétences attendues : excellente motivation, grande capacité d'organisation, travail en équipe, rigueur et bonne maîtrise de l'anglais est souhaitée.