Thèse Positionnement des Nucléosomes dans la Répression Transcriptionnelle du Vih une Approche Moléculaire Vers une Guérison. H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Montpellier
École doctorale : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé
Laboratoire de recherche : IGH - Institut de Génétique Humaine
Direction de la thèse : Monsef BENKIRANE ORCID 0000000282864405
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-05-11T23:59:59

Le VIH-1 code plusieurs protéines accessoires qui permettent au virus d'échapper aux mécanismes de restriction de l'hôte et d'établir une infection productive. Parmi celles-ci, la protéine virale Vpr reste l'une des moins comprises, malgré sa remarquable conservation évolutive et sa contribution essentielle à la réplication virale in vivo.
L'objectif de ce projet de thèse est d'élucider comment Vpr contrecarre un mécanisme de restriction basé sur la chromatine, qui régule le positionnement des nucléosomes et médie la répression transcriptionnelle du VIH.
En utilisant un nouveau modèle cellulaire in vitro, qui reproduit de manière unique la stricte dépendance à Vpr observée in vivo, ce projet étudiera comment Vpr surmonte les barrières épigénétiques inhibant l'expression des gènes viraux après intégration. Des résultats préliminaires suggèrent que Vpr est nécessaire pour lever une répression chromatinienne du génome du VIH, offrant une opportunité unique de définir l'interaction entre les voies de régulation de la chromatine virale et cellulaire.
Le ou la doctorant·e mettra en oeuvre une combinaison d'approches de virologie moléculaire, de biologie de la chromatine et de génomique fonctionnelle pour définir le mécanisme moléculaire par lequel Vpr module la structure de la chromatine et le positionnement des nucléosomes afin d'activer les provirus silencieux. Ces travaux contribueront à une meilleure compréhension des étapes précoces du cycle de vie du VIH, ainsi que des principes régissant la répression transcriptionnelle et la réactivation des génomes viraux intégrés.
L'étudiant·e rejoindra un environnement de recherche multidisciplinaire et collaboratif, offrant une formation en biologie moléculaire et cellulaire avancée, en épigénétique et en mécanismes de défense antivirale.

Nous recherchons un·e candidat·e motivé·e, passionné·e par la recherche fondamentale en virologie et épigénétique, et souhaitant contribuer à des avancées majeures dans la compréhension des mécanismes de latence du VIH. Le·a candidat·e idéal·e devra faire preuve des qualités suivantes :
1. Qualités personnelles et professionnelles
-Curiosité scientifique et esprit critique pour aborder des questions biologiques complexes.
-Rigueur et persévérance dans la conception et la réalisation d'expériences, avec une attention particulière à la reproductibilité des résultats.
-Esprit collaboratif et capacité à travailler en équipe dans un environnement multidisciplinaire.
-Autonomie et proactivité pour mener à bien un projet ambitieux sur 3 ans, tout en sachant solliciter l'aide de l'équipe lorsque nécessaire.
-Excellentes compétences en communication (orale et écrite) pour présenter les résultats en français et en anglais (réunions, congrès, publications).
2. Compétences techniques et académiques
-Formation requise :
oMaster 2 (ou équivalent) en virologie, biologie moléculaire, épigénétique, génomique, ou domaine connexe.
oExpérience préalable en culture cellulaire, techniques de biologie moléculaire (PCR, clonage, Western blot), et/ou analyse de données omiques (RNA-seq, ChIP-seq) serait un atout majeur.
-Compétences souhaitables :
oConnaissance des mécanismes de régulation épigénétique ou de l'interaction hôte-pathogène.
3. Adéquation avec le projet
-Intérêt marqué pour l'étude des mécanismes moléculaires de la latence virale et leur exploitation thérapeutique.
-Envie de s'investir dans un projet à fort impact scientifique et sociétal, avec des applications potentielles pour le développement de stratégies de guérison du VIH.
-Ouverture d'esprit pour apprendre de nouvelles techniques et s'adapter à l'évolution des objectifs du projet.
Candidature :
Les candidat·e·s sont invité·e·s à envoyer :
-Un CV détaillé (incluant formations, expériences en laboratoire, et compétences techniques).
-Une lettre de motivation expliquant leur intérêt pour le projet et leur adéquation avec le profil recherché.
-Les coordonnées de 2 références (encadrant·e·s de stage ou professeur·e·s).