Thèse Reprogrammation du Protéome par une Protéine de Tardigrade Dsup dans un Organisme Multicellulaire Approche Silac In Vivo H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Montpellier
École doctorale : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé
Laboratoire de recherche : CRBM - Centre de Recherche en Biologie cellulaire de Montpellier
Direction de la thèse : Dimitris XIRODIMAS ORCID 0000000192751140
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-05-11T23:59:59

La protéine Dsup (Damage suppressor), identifiée chez les tardigrades, confère une résistance remarquable aux dommages cellulaires, notamment induits par les rayonnements ionisants. Si ses effets protecteurs ont été démontrés dans des systèmes cellulaires, les mécanismes moléculaires impliqués restent encore mal compris, en particulier à l'échelle d'un organisme entier. Notre laboratoire a récemment découvert que l'expression de Dsup dans un organisme modèle, confère une résistance accrue aux radiations ainsi qu'au stress oxidatif, rallongeant la durée de vie de l'organisme (Richaud et al. , Science Advances 2023).
Le modèle Caenorhabditis elegans offre un système puissant pour étudier ces mécanismes grâce à sa génétique bien caractérisée et à la conservation de nombreuses voies de réponse au stress et du vieillissement.
Ce projet propose d'étudier les effets de Dsup dans C. elegans en combinant analyses phénotypiques et protéomique quantitative in vivo par SILAC, une approche développée et maîtrisée au laboratoire. L'objectif est d'identifier les modifications globales du protéome induites par Dsup et de comprendre comment celles-ci contribuent à la protection cellulaire.

Ce projet s'inscrit dans le domaine de la biologie du stress et du vieillissement, à l'interface de la génétique moléculaire, la biologie cellulaire et la protéomique quantitative. Il vise à comprendre comment une protéine issue d'un organisme extrêmophile peut moduler des voies cellulaires conservées dans un organisme modèle.

1.Caractériser les effets biologiques de Dsup chez C. elegans
Étudier l'impact de Dsup sur la résistance aux stress (oxydatif, génotoxique), la survie et la longévité.
2.Identifier les changements protéomiques induits par Dsup
Utiliser la protéomique quantitative SILAC in vivo pour comparer les profils protéiques entre animaux contrôles et exprimant Dsup, en conditions basales et sous stress.
3.Valider les voies et cibles impliquées
Tester les candidats identifiés par des approches génétiques (RNAi) et fonctionnelles afin de déterminer leur rôle dans les effets protecteurs observés.
Ce projet permettra de réaliser la première analyse globale du protéome in vivo associée à l'expression de Dsup dans un organisme multicellulaire.

Le projet reposera sur une approche intégrée combinant :
-Culture et manipulation de C. elegans
-Expression de Dsup par transgénèse
-Tests de résistance au stress et analyses de longévité
-Protéomique quantitative par SILAC in vivo
-Spectrométrie de masse et analyses bioinformatiques
-Validation fonctionnelle par RNAi et analyses ciblées

Formation en biologie (Master 2 ou équivalent)
-Intérêt pour la biologie cellulaire, la génétique ou la protéomique
-Motivation pour les approches expérimentales et quantitatives
-Rigueur, autonomie et capacité à travailler en équipe
Une expérience préalable en biologie moléculaire ou en manipulation de modèles biologiques sera appréciée.