Alternance - Ingénieur de Recherche Bioinformatique H/F - INSTITUT PASTEUR

L'Institut Pasteur conduit des recherches biomédicales de pointe et avant-gardistes depuis plus de 130 ans.
Sur notre campus de 5 hectares en plein Paris (15è arrondissement), dans un environnement multiculturel et stimulant, 3000 personnes collaborent pour répondre aux ambitions de l'Institut Pasteur.

Scientifique ou non, vous souhaitez rejoindre une entreprise qui prône la diversité, internationale, guidée par la curiosité, et qui place l'humain au coeur de son projet stratégique ? Alors postulez à nos offres ! Le Hub de Bioinformatique et Biostatistique est une équipe dont la mission est d'apporter un support en biologie computationnelle aux Unités de recherche et plateformes de l'Institut Pasteur. Le Hub est organisé en cinq pôles experts.

Missions :

Rattaché·e au pôle AIM - AI et Modélisation mathématique, l'alternant·e sera encadré·e par un·e ingénieur·e de la plateforme technologique.
Il/elle interviendra sur des projets menés en collaboration étroite avec les équipes de recherche de l'institut.

Les projets s'inscriront dans le cadre de l'application des méthodes d'apprentissage automatique et d'intelligence artificielle aux problématiques des sciences du vivant, notamment en génomique.

Les missions principales pourront inclure :
- Préparation, intégration et analyse de données biologiques hétérogènes (données génomiques, transcriptomiques, protéomiques, etc.)
- Développement, entraînement et évaluation de modèles d'apprentissage automatique et de réseaux de neurones profonds
- Adaptation et fine-tuning de modèles de langage appliqués à la biologie (modèles de langage génomiques et protéiques) pour différentes tâches (prédiction, annotation, classification, etc.)
- Mise en place de pipelines automatisés et développement d'outils d'aide à l'analyse, incluant l'utilisation d'agents IA
- Documentation des travaux, participation au suivi et à la gestion des projets en lien avec les équipes collaboratrices

Profil

- Formation en data science, mathématiques appliquées, informatique ou bioinformatique
- Bon niveau de programmation en python, plus particulièrement avec les librairies scientifiques et de machine learning (numpy, pandas, scikit-learn, pytorch)
- Goût pour le travail en équipe pluridisciplinaire
- Curiosité scientifique, intérêt pour les sciences de la vie notamment la génomique
- Anglais opérationnel