Thèse Imagerie de Contraste de Phase Différentiel à Base de Capteurs d'Image Innovants H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université Grenoble Alpes École doctorale : PHYS - Physique Laboratoire de recherche : CEA LETI - Laboratoire d'électronique et de technologie de l'information Direction de la thèse : Jérôme VAILLANT ORCID 000000031864339X Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-05-22T23:59:59 La bioproduction de médicaments est en plein essor et consiste à faire produire par des cellules les molécules d'intérêt. Pour cela, un suivi de la culture et de l'état des cellules est nécessaire.
L'imagerie de phase quantitative par holographie est une méthode optique sans marquage qui a déjà démontré sa capacité à mesurer la concentration et la viabilité des cellules cultivées. Toutefois l'implémentation de cette technique dans un bioréacteur se confronte à plusieurs difficultés liées à la forte concentration des cellules. Pour y remédier, nous souhaitons développer de nouvelles méthodes comme l'imagerie par contraste de phase différentiel en s'appuyant sur un capteur d'image innovant dont un prototype a déjà été réalisé au CEA-Leti.

Dans ce cadre, vous :
- Caractériserez et optimiserez le système optique utilisant ce nouveau capteur, puis vous validerez les performances sur des cultures cellulaires.
- Développerez les algorithmes de reconstruction et de traitement d'images
- Identifierez les points limitants du prototype actuel et définirez les spécifications d'un second prototype qui sera réalisé au CEA-Leti
- Enfin vous vous projetterez dans la réalisation d'une sonde in-line, plongée dans le bioréacteur La bioproduction de médicaments est en plein essor et consiste à faire produire par des cellules les molécules d'intérêt. Pour cela, un suivi optique sans marquage de la culture et de l'état des cellules est nécessaire. Aucune solution actuelle ne permet un tel suivi in-situ et en continu.

Master 2 ou diplôme d'ingénieur en optique ou en physique
Bonne maîtrise des outils de traitement d'images, des langages de programmation
Intérêt pour les applications en biologie cellulaire ou en bioproduction