Thèse Modélisation de la Dynamique Isotopique par la Modélisation Bioénergétique Isodym H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Lille
École doctorale : Sciences de la Matière du Rayonnement et de l'Environnement
Laboratoire de recherche : LOG - Océanologie et Géosciences
Direction de la thèse : Sébastien LEFEBVRE ORCID 0000000271525897
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-05-15T23:59:59

Ce projet de recherche vise à améliorer la compréhension et la modélisation des dynamiques isotopiques dans les réseaux trophiques marins, un enjeu crucial pour anticiper les impacts des changements globaux sur les écosystèmes et les services associés, tels que la pêche et la régulation climatique. Dans un contexte où les méthodes classiques d'analyse isotopique (modèles statiques) négligent souvent les variations temporelles des paramètres clés comme le facteur de discrimination trophique (TDF) et le taux de renouvellement isotopique (), notre équipe a développé des modèles de mélange dynamiques (DMM) intégrant explicitement ces dynamiques. Ces modèles, déjà appliqués avec succès dans des travaux antérieurs (Ballutaud et al., 2022 ; Cathelin et al., 2025), permettent de réduire significativement les biais dans l'estimation des régimes alimentaires et des flux trophiques. Le présent projet propose d'aller plus loin en couplant ces DMM avec le modèle mécaniste DIB (Dynamic Isotopic Budget), basé sur la théorie DEB (Dynamic Energy Budget), afin de prédire les variations du TDF et de en fonction de facteurs écologiques comme la température ou la disponibilité alimentaire. Ce couplage s'appuiera sur les archives numériques du DEB, couvrant plus de 7 000 espèces, et sera validé par des expériences de changement de régime alimentaire (DSE) menées sur des espèces emblématiques de la région Hauts-de-France, comme la moule et l'arénicole, ainsi que par l'analyse de jeux de données écologiques en cours d'acquisition. Les résultats attendus incluent le développement d'outils d'inférence isotopique conviviaux, sous forme de packages R open-source, ainsi que la publication d'articles dans des revues internationales de premier plan. Ce projet s'inscrit dans les priorités scientifiques du LOG et du laboratoire de ressources halieutiques de l'Ifremer, avec un impact potentiel majeur sur la gestion durable des ressources marines et la conservation des écosystèmes.

Cf document détaillé joint

Un réel intérêt pour l'écologie numérique en général est indispensable, ainsi qu'une bonne maîtrise de R pour les traitements de données. Des connaissances en écologie isotopique seraient bienvenues pour la compréhension du sujet, de la littérature associée, de l'analyse et de l'exploitation des résultats. Enfin, une bonne compréhension de l'anglais et une capacité à la synthèse bibliographique et à la rédaction scientifique sont aussi requises.