Thèse Cellules Dendritiques Plasmacytoïdes et Salmonellose Humaine Décrypter l'Identité Immunométabolique d'Un Acteur Clé mais Méconnu de l'Immunité Antibactérienne H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Toulouse École doctorale : BSB - Biologie, Santé, Biotechnologies Laboratoire de recherche : INFINITY - Institut Toulousain des Maladies Infectieuses et Inflammatoires Direction de la thèse : Joaquin PELLEGRINI ORCID 0000000235058638 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-05-15T23:59:59 Les cellules dendritiques plasmacytoïdes (pDC) sont des cellules immunitaires innées dotées d'une capacité exceptionnelle à produire de l'interféron de type I (IFN-I). Si leurs fonctions antivirales sont bien établies, leur rôle dans la défense antibactérienne reste largement non résolu. Des travaux récents du laboratoire d'accueil ont montré que Salmonella enterica Typhimurium infecte les pDC humaines et induit leur activation de manière dépendante des immunorécepteurs SLAMF7 et SLAMF8, qui régulent la production de cytokines et l'accumulation de ROS mitochondriales. De plus, SLAMF7 et SLAMF8 sont significativement surexprimés dans le transcriptome sanguin de patients atteints de salmonellose et associés à des signatures élevées d'IFN de type I, suggérant que ces récepteurs définissent un état d'activation fonctionnel distinct des pDC au cours de l'infection, susceptible d'influencer l'évolution de la maladie.
Sur la base de ces résultats, ce projet de doctorat vise à caractériser la biologie des pDC ainsi que le paysage immunitaire global chez des patients atteints de salmonellose, à travers un réseau de recherche translationnelle binational unique entre la France et l'Argentine.
À partir d'échantillons sanguins de patients, trois analyses complémentaires seront réalisées: i) un profilage immunométabolique à haute dimension par cytométrie spectrale; ii) une caractérisation fonctionnelle des pDC; et iii) une analyse intégrative des signatures immunitaires à l'aide d'approches de biologie des systèmes. L'objectif final est d'identifier des états des pDC dépendants de SLAMF ainsi que leurs endotypes immunitaires associés, en tant que corrélats potentiels de protection ou de susceptibilité dans la salmonellose, et de générer un jeu de données permettant l'identification future de cibles thérapeutiques dirigées contre l'hôte dans les infections bactériennes invasives.
Les cellules dendritiques plasmacytoïdes (pDC) représentent une population rare de cellules immunitaires innées, caractérisées par leur capacité unique à sécréter massivement de l'interféron de type I. Si leur rôle dans les infections virales est bien établi, leur participation à la défense antibactérienne, notamment face aux bactéries intracellulaires, reste très peu caractérisée.
L'accès à un réseau clinique binational France-Argentine, ainsi qu'à l'infrastructure technologique d'Infinity (cytométrie spectrale, génomique/transcriptomique, Human Immunomonitoring Core) fournissent une base solide pour caractériser la biologie des pDC directement chez des patients naturellement infectés. Ce projet adressera des questions restées sans réponse : quel est l'état phénotypique et fonctionnel des pDC chez les patients naturellement infectés par Salmonella? Les réponses immunitaires des patients permettent-elles de définir des endotypes distincts au cours de la salmonellose, associés à l'expression et à l'activité des récepteurs SLAMF?

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Plasmacytoid dendritic cells (pDCs) represent a rare population of innate immune cells, characterized by their unique capacity to produce large amounts of type I interferon. While their role in viral infections is well established, their contribution to antibacterial defense, particularly against intracellular bacteria, remains poorly characterized.
Access to a binational France-Argentina clinical network, as well as to the technological infrastructure of Infinity (spectral cytometry, genomics/transcriptomics, Human Immunomonitoring Core), provides a strong foundation to characterize pDC biology directly in naturally infected patients. This project will address unresolved questions: what is the phenotypic and functional state of pDCs in patients naturally infected with Salmonella? Do patient immune responses allow the definition of distinct endotypes during salmonellosis, associated with the expression and activity of SLAMF receptors?

- Formation en immunologie et en cytométrie en flux
- Expérience en techniques de biologie cellulaire
- Forte motivation pour acquérir des compétences en bioinformatique intégrative
- Esprit critique et aptitude au travail en équipe
- Bonnes compétences en communication en anglais