Thèse Mécanismes Moléculaires du Transfert et de l'Adaptation d'Un Plasmide Clinique Impliqué dans la Résistance aux Antibiotiques H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université Claude Bernard Lyon 1 École doctorale : E2M2 - Evolution Ecosystèmes Microbiologie Modélisation Laboratoire de recherche : MMSB - MICROBIOLOGIE MOLECULAIRE ET BIOCHIMIE STRUCTURALE Direction de la thèse : Sarah BIGOT ORCID 0000000293406303 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-06-09T23:59:59 L'émergence mondiale de bactéries multirésistantes constitue un enjeu majeur de santé publique. Les gènes de résistance sont souvent portés par des plasmides conjugatifs, dont le transfert entre bactéries représente un mécanisme central de dissémination. Le plasmide pOXA-48, impliqué dans la propagation de la résistance aux carbapénèmes chez les entérobactéries, est particulièrement préoccupant. Malgré son importance clinique, les bases moléculaires expliquant son transfert très efficace et sa capacité à s'établir durablement dans de nouveaux hôtes restent peu caractérisées.
La dissémination des plasmides repose sur une régulation fine permettant d'activer le transfert tout en limitant son coût pour la cellule donneuse, puis d'assurer l'établissement du plasmide dans une cellule receveuse où l'ADN entrant est initialement perçu comme étranger. Ce projet de thèse vise à décrypter les mécanismes contrôlant l'activation du transfert du pOXA-48, les événements précoces suivant l'entrée du plasmide dans la cellule receveuse et le rôle de gènes encore peu caractérisés dans l'adaptation à différents hôtes bactériens.
En combinant génétique bactérienne et imagerie en cellules vivantes, ce projet apportera des connaissances fondamentales sur les stratégies utilisées par les plasmides cliniquement pertinents pour se disséminer, et contribuera à une meilleure compréhension des mécanismes de propagation de la résistance aux antibiotiques.
La propagation des résistances aux antibiotiques est largement favorisée par le transfert horizontal de gènes via les plasmides conjugatifs. Bien que les grandes étapes de la conjugaison soient connues, les mécanismes moléculaires régulant finement ce processus et permettant l'adaptation des plasmides à différents hôtes restent encore mal compris. En particulier, le rôle de nombreux gènes plasmidiques demeure inconnu, limitant notre compréhension des stratégies de dissémination des plasmides cliniquement pertinents. Caractériser les mécanismes de propagation des résistances aux antibiotique par les plasmides conjugatifs Génétique bactérienne (construction de mutants, essais de conjugaison), biologie moléculaire (différentes techniques de clonage)

Master (ou équivalent) en microbiologie, biologie moléculaire ou génétique. Solides bases en génétique bactérienne. Une expérience en techniques de en microscopie serait une plus-value.