Thèse Nouveaux Outils Chimiques pour la Bioconjugaison Radicalaire de Protéines et de Cellules Vivantes. H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Nantes Université École doctorale : École doctorale Matière, Molécules, Matériaux et Géosciences Laboratoire de recherche : CHIMIE ET INTERDISCIPLINARITE : SYNTHESE, ANALYSE, MODELISATION Direction de la thèse : Sebastien GOUIN Date limite de candidature : 2026-05-31T00:00:00
Nous avons récemment développé une stratégie innovante de bioconjugaison électrochimique permettant l'ancrage site-sélectif d'une fonction chimique sur les résidus tyrosine de protéines sous l'application d'un potentiel électrique en solution. Cette réaction de bio-électroconjugaison se déroule en quelques minutes et constitue une méthode rapide et biocompatible pour la fonctionnalisation de vecteurs viraux, de bactéries et même de cellules entières, sans altérer leur viabilité (Nat. Commun., 2023, 14, 5122 ; Chem. Sci., 2021, 12, 15374-15381 ; J. Am. Chem. Soc., 2018, 140, 17120-17126).
L'objectif de cette thèse est d'étendre cette méthodologie en développant de nouvelles fonctions activables par oxydation chimique ou électrochimique. De nouveaux dérivés du motif N-méthylluminol (NML) seront synthétisés, optimisés et évalués pour leur capacité à marquer rapidement et de manière chimiosélective les résidus tyrosine des protéines.
Le/la doctorant(e) fonctionnalisera ces ancres NML avec des ligands originaux en vue de leur greffage sur des vecteurs viraux et des cellules immunitaires. Ces expériences de marquage seront menées en étroite collaboration avec notre partenaire biologiste nantais (laboratoire TaRGeT, UMR 1089).

Le laboratoire CEISAM offre un environnement de recherche de premier plan et dispose de l'ensemble des équipements nécessaires à la conduite de travaux en chimie organique.
Le groupe « Glycochimie et bioconjugués » développe des approches innovantes à l'interface de la chimie des glucides et de la bioconjugaison. Ses principales contributions scientifiques incluent :
1. le développement d'antagonistes glucidiques pour lutter contre l'inflammation intestinale induite par E. coli dans le contexte de la maladie de Crohn (concept ayant atteint les essais cliniques),
2. l'exploitation de la multivalence pour inhiber efficacement des enzymes bactériennes impliquées dans le métabolisme des glucides,
3. le développement de la première méthode de bioconjugaison électrochimique permettant le marquage de protéines, micro-organismes et cellules vivantes.
Le groupe « ChemICALS » du laboratoire TaRGeT dispose de toute l'infrastructure pour la caractérisation des réactions de bioconjugaison sur virus et cellules ainsi qu'une expertise reconnue pour les études in vitro et in vivo sur petit animal.

En permettant le greffage rapide de ligands innovants sur des vecteurs viraux et des cellules vivantes afin d'en améliorer les propriétés de ciblage, ce projet pourrait avoir un impact significatif dans les domaines de la thérapie génique et des approches cellulaires anticancéreuses.