Ingénieure de Recherche H/F - CNRS

Description du Poste Les Missions Mission principale La personne recrutée conduira des recherches en biologie computationnelle et bioinformatique, en étroite interaction avec des biologistes expérimentaux, afin d'analyser et d'intégrer des données single cell, multi omics et spatiales, et de développer des modèles permettant de décrypter la régulation génique médiée par les éléments rétrotransposables. L'Activité - Analyse de données single cell multi omics (scRNA seq, scATAC seq, multiome) issues de cellules immunitaires et cérébrales.- Intégration de données de transcriptomique spatiale et d'imagerie avec des atlas single cell.- Analyses à l'échelle d'atlas et intégration de cohortes publiques et internes.- Développement de modèles statistiques et d'apprentissage profond pour l'étude de la régulation génomique et des éléments transposables.- Développement, optimisation et maintenance de pipelines reproductibles (R, Python, Nextflow/Snakemake).- Contribution à la rédaction d'articles scientifiques et à la valorisation des résultats. Votre Profil Compétences Connaissances - Bioinformatique et biologie computationnelle.- Analyse de données single cell et multi omics.- Statistiques, apprentissage automatique et/ou deep learning.Savoir-faire - Excellente maîtrise de R et Python.- Développement de code propre, reproductible et documenté.- Utilisation d'outils de gestion de versions (git).- Expérience avec des pipelines de calcul (Nextflow, Snakemake ou équivalent)Aptitudes - Forte curiosité scientifique et autonomie.- Capacité à travailler en équipe interdisciplinaire.- Rigueur scientifique, sens de l'organisation et esprit collaboratif.- Votre Environnement de Travail Le laboratoire développe un programme de recherche interdisciplinaire à l'interface entre biologie computationnelle, génomique fonctionnelle et immunologie. Les travaux portent sur le rôle des rétrovirus endogènes humains (HERVs) et autres éléments mobiles du génome dans la régulation de l'immunité humaine et des fonctions génomiques, en conditions physiologiques et pathologiques.Les projets s'appuient sur des approches de pointe incluant le single cell et le spatial multi omics, l'intégration de cohortes à grande échelle, ainsi que le développement de modèles statistiques et d'apprentissage profond. Contraintes et risques Fort environnement interdisciplinaire et collaboratif.- Accès à des jeux de données à grande échelle (single cell, multi omics, spatial).- Accès à des infrastructures de calcul intensif (HPC).- Laboratoire situé au centre de Paris, avec un environnement de travail attractif. Rémunération et avantages Rémunération 3237 Congés et RTT annuels 44 jours Pratique et Indemnisation du TT Pratique et indemnisation du TT Transport Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu'à 300€ À propos de l'offre Référence de l'offre UMR8253-LEADID-004 Secteur d'activité Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement Emploi type Ingenieur biologiste en analyse de donnees (H/F) Expérience souhaitée 1 à 4 années À propos du CNRS Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d'associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement. Le CNRS Les métiers de la recherche