Thèse Développement et Formulation de Nano et Microparticulaires pour l'Administration de Bactériophages H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université Claude Bernard Lyon 1 École doctorale : EDISS - Interdisciplinaire Sciences-Santé Laboratoire de recherche : LAGEPP - Laboratoire d'Automatique, de Génie des Procédés et de Génie Pharmaceutique Direction de la thèse : Thomas BRIOT ORCID 0000000246934605 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-06-03T23:59:59 Le doctorant recruté sera formé dans différents domaines : formulations médicamenteuses, méthodes analytiques, microbiologie, études in vitro et phagothérapie. Ce projet de trois années, conçu pour le recrutement d'un doctorant a pour but d'améliorer les compétences scientifiques notamment dans les domaines pharmaceutiques et microbiologiques de celui-ci. Le projet sera divisé en quatre work packages. (1) Formulation et optimisation de particules (de taille nano et micrométrique) à base de polymères ainsi que caractérisations physico chimiques et par imagerie. (2) Bioproduction des phages d'intérêt en vue de leur encapsulation ou couplage avec les systèmes développés en (1). (3) Etudes de relargage et de stabilité dans le temps des phages depuis les systèmes développés. (4) Validation des nouveaux systèmes mis au point sur des cultures microbiologiques et cellulaires infectées. L'antibiorésistance est une problématique mondiale de santé publique et a progressé de 40% entre 2018 et 2023 selon le rapport de 2025 sur la surveillance de la résistance aux antibiotiques de l'organisation mondiale de la santé (1). Dans ce contexte de nouvelles solutions thérapeutiques anti-infectieuses doivent être recherchées. L'utilisation des bactériophages (phages) fait partie de ces alternatives. Néanmoins, les phages qui sont des virus sont sensibles aux environnements hostiles et doivent être administrés au plus proche du site infectieux. L'utilisation de stratégies d'encapsulation et de vectorisation peut permettre de lever ces deux verrous scientifiques et médicaux (2). - Formulations médicamenteuses : nanoparticules et microparticules à base de polymères seront formulées. Les polymères seront choisis et chimiquement modifiés en fonction de leur biocompatibilité. L'utilisation de polymères déjà utilisés en industrie pharmaceutique ou d'origine biologique sera privilégiée. Les caractérisations physico-chimiques des polymères synthétisés et des particules formulées feront intervenir différentes méthodes permettant de caractériser les polymorphismes des polymères, et différentes technologies, comme l'analyse thermique et mécanique. Les particules formulées seront caractérisées sur des critères de taille, morphologie, charge de surface.
- Bioproduction des phages : amplification des bactériophages sur cultures bactériennes et purification des virions obtenus par des méthodes de chromatographies échangeuses d'ions, précipitation. L'activité antibactérienne sera mesurée par la capacité des bactériophages à former des plages de lyse (méthode EOP, Efficiency of plaquing).
- Etude de relargage et de stabilité : mesure des paramètres particules dans différents milieux, après formulation mais également dans des milieux biologiques simulés (milieux digestifs par exemple). L'activité anti infectieuse au cours du temps sera également suivie par méthode EOP.
- Validation des systèmes mis au point sur des modèles biologiques. L'activité antibactérienne des phages sera mesurée sur des cultures microbiologiques (E. Coli, S. aureus, P. aeruginosa) et cellulaires infectées (cultures de macrophages dans le cas d'infections bactériennes intracellulaires). Des études d'internalisation cellulaire utilisant des nanoparticules fluorescentes seront réalisées. La cytotoxicité des nanoparticules sera également évaluée sur des modèles de cellules humaines à l'aide de tests biochimiques.

Niveau master 2 en sciences pharmaceutiques, biologiques ou chimiques. Expériences préalables souhaitées en formulation, caractérisations physico-chimiques, microbiologie ou culture cellulaire. Bonnes compétences orales et écrites en anglais.