Thèse Etude du Dialogue Bidirectionnel Tissus Adipeux - Cellules Cancéreuse par Traçage en Chimie Click H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Toulouse École doctorale : BSB - Biologie, Santé, Biotechnologies Laboratoire de recherche : I2MC - Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires Direction de la thèse : Justine BERTRAND-MICHEL ORCID 0000000198151517 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-05-30T23:59:59 Les tissus adipeux (TA) chez les mammifères se présentent sous forme de dépôts multiples, principalement composés d'adipocytes, des cellules aux fonctions métaboliques (stockage et libération d'acides gras libres, AGL) et endocrines (sécrétion d'hormones, cytokines, lipides bioactifs). Bien que les TA viscéraux et sous-cutanés soient les plus étudiés pour leur rôle dans la régulation métabolique, d'autres dépôts spécifiques (mammaires, périprostatiques, médullaires) exercent un effet paracrine sur les organes voisins, plutôt que sur l'homéostasie énergétique globale. Ces TA associés aux organes sont aussi présents près des tumeurs primaires (sein, prostate) ou des sites métastatiques (os, fréquents dans les cancers du sein et de la prostate). Leurs adipocytes favorisent l'agressivité tumorale en transférant des AGL aux cellules cancéreuses, qui les utilisent comme source d'énergie. Cependant, d'autres lipides bioactifs (non encore caractérisés) pourraient aussi moduler le métabolisme tumoral. Leur identification, leur transfert dynamique vers les cellules cancéreuses et leur impact sur ces dernières restent peu compris. Les objectifs de la thèse seront de i) cartographier le métabolisme des adipocytes pour identifier les lipides qu'ils libèrent, ii) d'étudier le flux des lipides sécrétés vers les cellules tumorales et iii) d'analyser le remodelage métabolique induit par ces lipides dans les cellules cancéreuses. Pour suivre ce trafic lipidique, des approches conventionnelles (lipidomique par spectrométrie de masse) et innovantes seront combinées avec de traçage métabolique classique reposant sur l'utilisation d'AG marqués au ¹³C ou au deutérium et la mise en place de la chimie « click » consistant à incorporer des AG fonctionnalisés (groupement alkyle cliquable) dans des lipides complexes (triacylglycérides, phospholipides, sphingolipides, oxylipines, FAHFAs). Après extraction, ces lipides sont marqués par chimie click, puis profilés par spectrométrie de masse (SM) ce qui permet de suivre rapidement et précisément l'incorporation des AG dans des lipides complexes, leur libération dans le milieu extracellulaire. Cette méthode, appliquée à la fois aux adipocytes et aux cellules tumorales, permettra la caractérisation fine du lipidome des adipocytes et des cellules cancéreuses en coculture, et l'analyse du dialogue métabolique bidirectionnel entre ces deux types cellulaires. Ainsi, ce projet vise à élucider les mécanismes par lesquels les adipocytes alimentent les tumeurs en lipides, ouvrant des pistes pour cibler ces interactions dans le traitement du cancer. Ce projet de développement technologique de suivis anabolique et catabolique des lipides se situe au front de science de la métabolique et proposera des outils pour approfondir le métabolisme du cancer tout particulièrement le dialogue cellulaire entre tissus adipeux et cellules cancéreuse Développer et mettre en place des outils de traçage métabolique des lipides (13C et chimie click) par spectrométrie de masse pour étudier le dialogue cellulaire entre les adipocytes et les cellules cancéreuses. Spectrométrie de masse
Lipidomique
Extraction lipidique
Isolation d'adipocytes
Culture cellulaires et coculture

Le projet repose largement sur la mise en place d'outils et de workflow de lipidomique, l 'étudiant recruté doit avoir préferenciellement un profil de chimiste analyste. Il.elle peut être issu d'un Master 2 de chimie analytique, biotechnologie ou métabolomique, ou encore d'une école ingénieur chimie.