Thèse Doctorat en Microfabrication pour l'Imagerie Biologique et la Culture d'Assemblages Cellulaires Biologiques H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Bordeaux École doctorale : Sciences Physiques et de l'Ingénieur Laboratoire de recherche : Laboratoire Photonique, Numérique & Nanosciences Direction de la thèse : Gaëlle RECHER ORCID 0000000190040118 Début de la thèse : 2026-10-01 Sujet de thèse
Le projet PAPILLON développe une plateforme intégrée pour piloter et quantifier la différenciation de
sphéroïdes humains dérivés de cellules souches pluripotentes induites. Trois verrous structurent le projet : architecture et fabrication de la puce PAPILLON, programmation fluidique de la différenciation, et intégration dans un système d'imagerie et d'analyse automatisées.
Il repose d'abord sur le développement d'une puce microfluidique permettant le piégeage contrôlé d'une dizaine de sphéroïdes et compatible avec une imagerie avancée en conditions d'incubation. Dans cette puce, des séquences automatisées et finement modulées de perfusion de milieux de culture imposeront des trajectoires de différenciation reproductibles aux sphéroïdes.
On fera l'imagerie en temps réel de cette dynamique pour produire des données moyen débit sur cette physiologie des sphéroïdes. L'accent sera mis sur une approche à bas coût et largement open source afin d'abaisser les barrières technologiques pour la communauté.

selon les profils des candidats