Assistant·e Ingénieur·e en Séquençage Ngs H/F - Service Public

Depuis 2012, l'Institut de Génomique Fonctionnelle de Lyon (IGFL) développe la plateforme de séquençage haut débit PSI, aujourd'hui en forte croissance et reconnue pour son expertise en génomique et technologies NGS.
La plateforme réalise un large éventail d'applications de séquençage (DNAseq, RNAseq, miRNAseq, ChIPseq, Bisulfite-seq, séquençage de longs fragments, etc.) et s'appuie sur un parc technologique de pointe intégrant les principales solutions du marché, notamment Illumina et Oxford Nanopore Technologies.
Pour répondre à une activité en pleine expansion et accompagner ses projets de recherche collaboratifs, la plateforme PSI recrute un·e Assistant·e ingénieur·e spécialisé·e en séquençage NGS.

MISSIONS :

Biologiste moléculaire, vous mettez en oeuvre les techniques de séquençage NGS au sein de la plateforme PSI, notamment sur les technologies Illumina (NextSeq500, MiSeq) et Oxford Nanopore Technologies (PromethION P2), dans le cadre de projets de recherche, de collaborations scientifiques et de prestations de service.
Vous assurez l'ensemble des étapes des projets de séquençage, de la préparation des échantillons à l'acquisition et à la valorisation des données de séquençage haut débit, dans le cadre de collaborations de recherche et de prestations.
Vous contribuez également au bon fonctionnement général de la plateforme à travers des missions d'intérêt collectif et assurez un rôle de soutien technique essentiel à son organisation.

ACTIVITES PRINCIPALES :

- Participer à la réalisation des projets scientifiques (collaborations de recherche, contrats industriel, ANR, prestation de service, ...) et aux développements technologiques de la plateforme

- Gérer et conduire des projets de séquençage de routine

- Rédiger les comptes rendus des expérimentations réalisées et les synthèses des résultats obtenus, et présenter les résultats expérimentaux.

- Synthétiser les procédures techniques et les protocoles appliqués

- Participer à la gestion et l'organisation généra...

Connaissances sur l'environnement professionnel :

- Expérience professionnelle et connaissances solides séquençage haut débit (NGS)

- Maîtrise des bases théoriques et pratiques du séquençage sur Illumina (MiSeq, NextSeq500) et Oxford Nanopore Technologies (PromethION P2 solo)

- Connaissance des règles d'hygiène et de sécurité ainsi que des Bonnes Pratiques de Laboratoire (BPL)

- Anglais scientifique niveau B1

Savoir-faire opérationnels :

- Maitrise des techniques de biologie moléculaire : extraction, purification et contrôle qualité des acides nucléiques (quantification, qualification), PCR, RT-PCR, qPCR

- Construction et qualification de banques NGS et réalisation de séquençage haut débit

- Maîtriser l'utilisation des séquenceurs et les équipements périphériques

- Bonne connaissance des outils bureautiques et informatiqu...