Bio Informaticien·ne H/F - Siege Administratif
- Lyon 4e - 69
- CDD
- Siege Administratif
Les missions du poste
MISSIONS
- Vos missions seront en lien avec l'IHU Everest, avec pour mission principale d'améliorer les pipelines de caractérisation des virus des hépatites B et D.
- Adapter/modifier les pipelines développés en interne VirIONT en particulier, en fonction des nouveaux besoins.
- De manière autonome, évaluer, choisir, adapter et implémenter les méthodes d'analyses répondant aux besoins biologiques.
- Pouvoir participer à la gestion des pipelines d'analyse sous une forme souple, facilement maintenable et produisant des résultats reproductibles (Nextflow, Singularity).
QUALIFICATIONS
- Etre titulaire d'un diplôme en bio informatique ou biologie computationnelle ou génomique
- Expérience d'analyse des données de NGS
- Expérience préalable en analyse de données de séquençage bactérien, viral et fongique est fortement souhaitée.
- Expérience de réponse aux besoins des non-initiés à la bio-informatique.
COMPÉTENCES
- Maîtrise des outils et environnements de bioinformatiques : langages de programmation(Unix, R, Python, bash, Nextflow), outils de traitement de séquences : (BWA, Bowtie2, SPAdes, FastQC, SAMtools, GATK..).
- Formation en microbiologie en sus de la formation bio-informatique valorisée.
- Connaissance des environnements de calcul scientifique et d'un ordonnanceur (OAR, SLURM.) appréciée.
- Aptitudes à la rédaction de méthodes et d'articles scientifiques (français et anglais).
- Connaissance en phylogénie et des bases de données publiques de génétique (RefSeq, Ensembl.) appréciée.
SAVOIR-ÊTRE
- Rigueur scientifique, aptitudes organisationnelles.
- -Aptitudes relationnelles et goût pour le travail en équipe.
- -Bonne maîtrise de l'anglais scientifique et technique.
Le profil recherché
Experience: 2 An(s) - BIOINFORMATIQUE
Compétences: Analyse de données expérimentales,Langages de programmation informatique,Analyser des résultats d'exploitation bio-informatiques,Collecter et analyser des données, des informations,Relayer de l'information
Qualification: Cadre
Secteur d'activité: Activités hospitalières