Chargé d'Étude en Analyse de Données Télémétriques H/F - Muséum National d'Histoire Naturelle

Contexte du recrutement et définition de posteLe projet HABITRACK, financé par l'Union européenne dans le cadre du programme HORIZON-CL6-2023-BIODIV-01-4, vise à apporter de meilleurs méthodes et connaissances pour améliorer l'état de conservation des espèces et habitats protégés par l'UE, en ciblant spécifiquement les espèces d'oiseaux chassables, listées à l'annexe II de la Directive Oiseaux, en mauvais état de conservation. Il réunit un consortium de huit partenaires issus de cinq pays (France, Tchéquie, Allemagne, Pays-Bas et Finlande).Dans cet objectif, 14 espèces ont été ciblées, principalement des limicoles et des canards. HABITRACK a mis en place le déploiement massif de balises GPS pour chacune des espèces étudiées, en complémentarité avec les données existantes. Depuis 2024, le consortium de scientifiques et ses collaborateurs construisent un cadre d'analyse pour relier les besoins en habitats, les tendances démographiques et les performances de reproduction des oiseaux, et développent de nouvelles méthodes pour estimer les paramètres à intégrer dans les modèles démographiques (voir Publications & Rapports). Ces analyses ont été déployées en premier lieu sur les espèces « preuve de concept » pour lesquelles les données étaient immédiatement disponibles grâce aux données de télémétrie récoltées préalablement (Courlis cendré, Tourterelle des bois).L'un des enjeux majeurs du projet HABITRACK est d'étendre à l'ensemble des 14 espèces étudiées le cadre analytique développé au cours des premières phases du projet. Cela permettra d'étudier la généralisation des premiers résultats obtenus, d'identifier les processus écologiques communs aux différentes espèces et de quantifier la variabilité de ces processus à travers les différents traits d'histoire de vie des espèces. Cette montée en généralisation implique d'adapter et de tester la transférabilité du cadre d'analyse initialement développé à travers l'hétérogénité des jeux de données et la diversité des caractéristiques biologiques des espèces étudiées.Dans ce contexte, deux cadres d'analyse développés par L. Bartholus au cours de sa thèse (2024-2027) ont été identifiés comme prioritaires et constitueront le coeur des missions de chaque poste :1) L'étude de l'effet de la capture et du port de la balise GPS sur l'activité des oiseaux à partir des données d'accélérométrie - développé sur la Bécassine des marais2) L'étude de la sélection d'habitat des oiseaux à l'échelle européenne à partir des données GPS - développé sur la Tourterelle des BoisL'objectif principal sera d'adapter ces méthodes afin de les appliquer de manière harmonisée aux différentes espèces du projet, en développant des procédures d'analyse reproductibles et comparables entre espèces. En fonction de l'avancement du projet, des missions complémentaires pourront être confiées en appui à l'équipe HABITRACK du MNHN ou des autres partenaires du consortium.DESCRIPTION DES MISSIONS :1) Prendre en main les données d'accélérométrie (poste 1) GPS ou d'accélérométrie (poste 2) des différentes espèces2) Réaliser un diagnostic de la qualité des données pour la question posée3) Adapter et généraliser les scripts existants afin de développer une routine d'analyse reproductible applicable à l'ensemble des espèces4) Produire les résultats, figures et synthèses nécessaires à leur interprétation.5) Participer à la préparation des résultats en vue de publications scientifiquesPartenaires internes :-l'équipe HABITRACK basée au CESCO : Lise Bartholus, Frédéric Jiguet, Anne-Christine Monnet-l'équipe du CESCO ainsi que les équipes de Vigie-Nature (20 personnes dont ingénieurs en charges de la gestion des données, des analyses et des restitutions) et du CRBPOPartenaires externes : Co-porteurs du projet européen HABITRACK (8 institutions européennes partenaires) incluant des chercheur.e.s, postdoctorant.e.s et doctorant.e.sProfil recherchéFormation initiale :Titulaire d'un Bac +5 (Master 2 ou école d'ingénieurs) minimum avec un cursus en écologie / sciences de la vie / agronomie avec une forte composante en analyses de données OU un cursus en statistiques appliquées avec un intérêt pour les questions de biodiversité / écologie.Connaissances :-Maîtrise des méthodes statistiques fréquentistes classiques (modèle linéaire, GLM, effets aléatoires, GAM)-Programmation sur R avancée (gestion de données, visualisation, définition de fonction, GIS, annotation de scripts)-Maîtrise des outils de versionnage et de travail collaboratif (Git)-Bon niveau d'anglais scientifique (au minimum lu et écrit), permettant de comprendre la documentation technique et les publications scientifiques, de rédiger et commenter les scripts en anglais conformément aux pratiques du consortium, et d'échanger par écrit avec les partenaires européensSavoir-être professionnel :-Capacités de communication, de présentation écrite et orale et de synthèse-Sens de l'écoute, du dialogue et du consensus-Travail en équipe n'excluant pas l'autonomie et l'esprit d'initiative-Sociabilité, disponibilité et mobilitéInformation(s) complémentaire(s)Venez rejoindre un établissement chargé d'histoire, engagé dans la société, en pleine évolution, à la renommée nationale et internationale. Riche d'une grande variété de métiers et d'activités, le Muséum vous propose d'intégrer des équipes à taille humaine dans un cadre de travail agréable et un environnement stimulant.Ce dossier doit comprendre :- un curriculum vitae ;- une lettre de motivation expliquant les expériences, compétences et moyens que le ou la candidat·e mettra en oeuvre pour assurer la réalisation des missions décrites dans cette fiche de poste.Le contratLocalisation : Jardin des plantesContrat : Contrat de projet de 12 à 15 mois suivant la date de prise de poste.Temps de travail : 35h35 par semaine et 44 jours de congés annuels.Les avantagesRemboursement de 75% des frais de transport en commun ou forfait mobilité durable (vélo ou covoiturage)Télétravail possible après 4 mois d'ancienneté (de 1 ou 2 jours selon les fonctions, activités, service et contexte de travail)Restaurant d'entreprisePrise en charge partielle de votre mutuelleUn comité social et une association sportive et culturelleAccès illimité aux sites de l'établissement avec invités