Doctorat Portant sur l'Étude des Écosystèmes Méditerranéens Post-Incendie H/F - CNRS

Description du Poste Sujet De Thèse Si la résilience des plantes après incendie a traditionnellement été étudiée à l'échelle de l'organisme, des travaux récents suggèrent que les plantes et leurs communautés microbiennes associées constituent une entité fonctionnelle intégrée - l'holobionte végétal - dont les interactions chimiques et le métabolisme collectif jouent un rôle déterminant dans l'adaptation aux perturbations environnementales. Le projet MULTICHEM-HOLO propose de tester l'hypothèse selon laquelle la résilience post-incendie est une propriété émergente de cet holobionte, résultant d'interactions dynamiques entre la plante, son microbiome et leurs métabolites spécialisés. Pour répondre à cette question, il développera une approche intégrative combinant l'écologie chimique, l'analyse du microbiome, la métabolomique multimodale et l'intelligence artificielle afin d'identifier les signatures moléculaires de la résilience et de décrypter les mécanismes sous-jacents à la récupération des écosystèmes méditerranéens après un incendie.o Activité 1 : campagnes de terrain seront menées dans des écosystèmes méditerranéens en Grèce et en Franceo Activité 2 : Des tissus végétaux, la rhizosphère et les sols environnants seront prélevés sur des sites brûlés et non brûlés afin de caractériser la résilience écologique et d'étudier la diversité et la composition fonctionnelle des communautés microbiennes associéeso Activité 3 : profilage du microbiome, culturomique microbienne et métabolomique multimodale reposant sur la LC-HRMS/MS, la GC-MS/MS et des approches avancées de RMNo Activité 4 : statistiques multivariées et apprentissage automatique afin d'identifier des biomarqueurs microbiens et chimiques de la résilience et de révéler les interactions reliant la composition du microbiome, le métabolisme spécialisé et la restauration écologiqueo Activité 5 : établir une preuve de concept démontrant que l'holobionte est un élément fonctionnel impliqué dans la résilience des plantes après un feu de forêt Votre Environnement de Travail Thèse internationale impliquant 3 unités de recherche (ICMR et ECSN en France et NPMC à Athènes), campagnes de collectes sur le terrain en France et en Grèce.Moyens mis à disposition (appareillage, informatique...) : Poste de travail informatique, logiciels spécifiques, plateforme analytique, laboratoire de chimie et de microbiologiePrincipaux interlocuteurs (réseau relationnel intra ou extra CNRS) : JH RENAULT (ICMR), Véronique EPARVIER (ICSN), Maria HALABALAKI (NPMC, Athènes) Contraintes et risques La thèse conduira la personne recrutée à travailler au sein de trois équipes de recherche (Reims, Gif-sur-Yvette, Athènes) // Missions de terrain Rémunération et avantages Rémunération La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel Congés et RTT annuels 44 jours Pratique et Indemnisation du TT Pratique et indemnisation du TT Transport Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu'à 300€ À propos de l'offre Référence de l'offre UMR7312-ELOMET-003 Section(s) CN / Domaine de recherche Chimie et vivant À propos du CNRS Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d'associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement. Le CNRS Les métiers de la recherche