Stage M2 Cartographie Haute-Résolution de l'Activité de Pêche de Baie de Seine par Fusion de Données Multi-Sources H/F - Ifremer

Rejoignez l'Ifremer pour un océan mieux compris, mieux protégé qui demeure un allié du bien-vivre sur la planète

Des abysses à la surface, de la côte au large, l'Ifremer est l'institut de recherche français entièrement dédié à l'Océan. Ses équipes mènent des recherches, innovent et produisent des expertises pour protéger l'océan, exploiter ses ressources de manière responsable et partager les données marines.

L'Ifremer apporte son expertise scientifique pour éclairer les politiques publiques et élabore des solutions puisées dans l'océan pour répondre aux enjeux de la transition écologique. Opérateur de la Flotte océanographique française avec sa filiale d'armement Genavir, l'Ifremer imagine, conçoit et déploie des moyens technologiques de pointe pour percer les mystères de l'océan.

Rejoignez nos équipes, composées de 1500 scientifiques et métiers supports à la recherche, et présentes sur tout le littoral métropolitain et en Outre-mer.

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Date de clôture de réception des candidatures : 13/11/26

• Présentation de la structure de rattachement : Le stage est accueilli au laboratoire Ressources Halieutiques de l'Ifremer (unité halieutique Manche et Mer du Nord), à la Station Ifremer de Port-en-Bessin. Le laboratoire conduit notamment l'évaluation du stock de coquille Saint-Jacques de la baie de Seine (campagnes scientifiques COMOR) et participe au projet EXPLOREM, porté par le comité régional des pêches maritimes et des élevages marins de Normandie. Ce projet vise à acquérir des connaissances locales, fondées sur des observations in situ, sur l'impact des engins de pêche de fond sur les habitats et les espèces benthiques.
• Position dans l'organigramme : Stagiaire intégré·e à l'équipe du laboratoire Ressources Halieutiques (unité HMMN), au sein du projet EXPLOREM.
• Rattachement hiérarchique : Stagiaire encadré·e par Anna Mazaleyrat, Laurent Dubroca et Eric Foucher.

Mission - Finalité de l'emploi

Mettre en place une estimation robuste et spatialement explicite de l'activité de pêche (effort et capture) des dragues à coquille Saint-Jacques en baie de Seine, en appliquant et en comparant les méthodes existantes de traitement des données de positionnement des navires et des livrets de bord [1]. Les cartes d'intensité de dragage et de captures obtenues, accompagnées de leurs incertitudes, serviront à définir le gradient de pression de pêche sur lequel s'appuiera le plan d'échantillonnage des habitats benthiques du projet EXPLOREM [2]. L'analyse des évolutions de la distribution des efforts permettra également de qualifier l'évolution des pratiques au regard des modifications du milieu (zone de jachère tournante, installation d'un parc éolien dans la zone, etc.) [3].

Contexte : avec environ 27 000 tonnes débarquées en 2022 et plus de 200 navires actifs en moyenne chaque mois pendant la saison d'ouverture, la drague à coquille Saint-Jacques est le premier métier de la pêche normande. Quantifier l'impact sur les fonds marins nécessite de connaître précisément où, combien et à quelle fréquence les fonds sont dragués. Or, la littérature montre que les estimations d'effort des dragues dépendent fortement de la source de données (couverture de la flottille, fréquence des positions) [4, 5], de la méthode d'identification des positions de pêche (seuils de vitesse, modèles de mélange, apprentissage supervisé, modèles de Markov cachés) [3, 6, 7], de l'interpolation des trajectoires et de la résolution spatiale retenue [4]. Le système de surveillance des navires par satellite (VMS, Vessel Monitoring System) n'a longtemps équipé que les navires de 12 m et plus [8] et ne transmet réglementairement qu'une position toutes les deux heures, puis toutes les 30 minutes à partir de juillet 2027 [9] : il décrit donc mal les trajectoires sinueuses des dragueurs [5]. Le système d'identification automatique (AIS, Automatic Identification System), conçu pour la sécurité de la navigation, émet des positions beaucoup plus fréquemment, mais présente des lacunes de couverture [4, 10]. Les produits d'effort de pêche diffusés librement par Global Fishing Watch, une organisation internationale à but non lucratif, sont dérivés des données AIS [11] et n'ont pas encore été évalués pour cette pêcherie.

Description des activités principales

• Prendre connaissance de la revue bibliographique du projet sur le calcul et la représentation spatiale de l'effort des dragues, et la compléter si nécessaire.
• S'approprier les bases de données à disposition au laboratoire : trajectoires des navires vues par la VMS et l'AIS, données déclaratives [1] et fichier de flotte. Compléter cette base avec l'effort de pêche apparent de Global Fishing Watch (accès via l'API, paquet R gfwr).
• En s'appuyant sur les approches et les chaînes de traitement déjà développées au laboratoire, le ou la stagiaire pourra :
  • Mettre en oeuvre la chaîne de traitement des trajectoires : nettoyage, identification des positions de pêche, interpolation des trajectoires puis calcul des temps de pêche, des taux de balayage (swept area ratio) à partir des caractéristiques des dragues [12], ainsi que des captures résultantes.
  • Comparer les sources de données (VMS, AIS, Global Fishing Watch) : couverture des navires et du temps de pêche, concordance spatiale des cartes, sensibilité des indicateurs à la fréquence des positions et à la taille de maille [4, 5].
  • Produire des cartes d'effort et d'intensité de dragage par saison de pêche et à différentes résolutions spatiales, en quantifiant l'incertitude associée.
  • Identifier un gradient d'intensité de dragage et, avec les partenaires du projet, proposer des zones contrastées pour le plan d'échantillonnage des habitats benthiques.
  • Travailler dans un canevas analytique reproductible et documenté (R, Quarto, gestion de versions), réutilisable pour les mises à jour annuelles.
• Rédiger le rapport de stage et présenter les résultats à l'équipe d'encadrement et aux partenaires du projet.
• Participer ponctuellement à des travaux de terrain (campagnes scientifiques, embarquements).

Responsabilités exercées et latitude d'action

• Type de responsabilité : être garant·e de la qualité des traitements de données, des analyses spatiales et des cartes produites, de la traçabilité du code et du respect strict des règles de confidentialité applicables aux données individuelles de positionnement et de déclaration des navires.
• Niveau d'autonomie : un profil méthodique et autonome est attendu ; le ou la stagiaire conduit les traitements et les analyses dans le cadre défini avec l'équipe d'encadrement. Les choix méthodologiques structurants (sources de données retenues, méthode d'identification des positions de pêche, résolution spatiale, définition du gradient de pression) et toute diffusion de résultats issus de données confidentielles seront accompagnés, discutés et validés avec les encadrants.

Champ relationnel :

• En interne : équipe d'encadrement (Anna Mazaleyrat, Laurent Dubroca et Eric Foucher) et équipes du laboratoire Ressources Halieutiques (unité HMMN) ; équipes du Système d'Informations Halieutiques de l'Ifremer (unité HISSEO) pour l'accès aux données VMS et déclaratives.
• En externe : partenaires du projet EXPLOREM : CRPMEM de Normandie (chef de file), Université de Caen Normandie, et partenaires techniques de la filière (OPN, FROM Nord, Normandie Fraîcheur Mer) ; professionnels de la pêche à la coquille Saint-Jacques.

Compétences requises :

• Connaissance du langage R pour la manipulation de données volumineuses et l'analyse spatiale (sf, terra, data.table ou équivalents).
• Connaissances en statistiques et en analyse de données spatiales ; une expérience de l'analyse de trajectoires ou des données de positionnement (VMS, AIS, GPS) est un plus.
• Connaissances en halieutique ou en écologie marine, en particulier sur les engins de pêche et leurs interactions avec les fonds marins.
• Capacité à lire la littérature scientifique en anglais et à en extraire des méthodes adaptées.

Qualités :

• Une appétence pour la manipulation de données complexes, volumineuses et spatialisées, ainsi que pour l'élaboration et l'analyse d'objets géographiques.
• Profil méthodique, rigoureux et autonome.
• Respect de la confidentialité des données.
• Aptitude à travailler au sein d'un laboratoire à taille humaine, où les interactions entre les équipes sont nombreuses, ainsi qu'à échanger avec des professionnels de la pêche.
• Qualités de synthèse et de restitution, à l'écrit comme à l'oral.