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Ingénieur·e de Recherche H/F - Logo Institut Agro

  • Dijon - 21
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Publié le 25 juin 2025
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Les missions du poste

L'ingénieur(e) de recherche recruté(e) contribuera activement au projet PEPR BACTER-EV-BOOSTER, financé par la stratégie nationale d'accélération « Biothérapies et Bioproduction de Thérapies Innovantes » (BBIT) du plan Innovation Santé 2030. Ce projet vise à développer une biothérapie innovante à base de vésicules extracellulaires (EVs) issues de bactéries intestinales comme alternative aux probiotiques vivants.

Au sein de l'UMR PAM, reconnue internationalement pour son expertise dans le domaine des procédés de culture des bactéries intestinales anaérobies et de stabilisation des biomolécules, l'ingénieur(e) mènera des travaux de recherche sur la bio-production, la caractérisation et la stabilisation des EVs, en étroite collaboration avec les autres partenaires du consortium national.

Le profil recherché

Agent contractuel de catégorie A

CDD de 24 mois à pourvoir à compter du 01/09/2025

Temps de travail 100%

Salaire mensuel brut à partir de 2 426 €

Vos missions :
- L'ingénieur(e) de recherche participera à l'ensemble des étapes du programme scientifique, incluant :
1. Caractérisation physico-chimique des EVs
- Mise en oeuvre de techniques de microscopie (MEB, MET, AFM, CLSM), de spectroscopie et d'analyse physico-chimique (DLS, zêta potentiel, etc.) pour étudier la morphologie, la taille, les charges de surface et les interactions moléculaires des EVs.
2. Étude de la stabilité des EVs
-Analyse de la stabilité structurale et fonctionnelle des vésicules soumises à divers stress physico-chimiques (pH, température, oxydation, cisaillement, etc.).
-Etude de l'effet des matrices d'encapsulation (sucres, sels, biopolymères) sur l'intégrité et l'activité des EVs.
3. Développement de procédés de stabilisation
Deux approches complémentaires seront explorées pour stabiliser les vésicules extracellulaires (EVs) :
- La conservation par procédés de séchage (lyophilisation, atomisation) ou de congélation. Une attention particulière sera portée à l'effet des conditions expérimentales (température, temps, cinétique) ainsi qu'à l'impact des matrices protectrices (co-solvants tels que sucres, sels, biopolymères), afin d'optimiser la préservation de l'intégrité structurelle et de l'activité biologique des EVs.
- L'encapsulation des EVs dans des matrices fonctionnelles, telles que des microgels, des émulsions ou via des procédés de microfluidique. Ces systèmes seront ensuite caractérisés pour évaluer leur performance en termes (i) de propriétés physico-chimiques (taille, rhéologie, calorimétrie différentielle), (ii) de taux d'encapsulation et de stabilisation des EVs, (iii) de maintien de l'activité biologique des EVs et (iv) de relargage contrôlé dans des conditions simulant le tractus gastro-intestinal.
4. Activités transverses et de gestion de projet
-Réalisation de recherches bibliographiques, rédaction de rapports et d'articles scientifiques (en anglais), présentations mensuelles des résultats à l'équipe.
-Participation à des congrès scientifiques (communications orales et posters).
-Travail en interaction avec les doctorant(e)s, postdoctorant(e)s et ingénieur(e)s de l'équipe.
-Gestion opérationnelle des expériences en collaboration avec les membres du consortium

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Profil de formation et compétences liées au poste :
- Connaissance des procédés de production microbienne en réacteur régulé et des procédés de séparation et de stabilisation des entités biologiques
- Connaissance des processus biologiques liés aux bactéries anaérobies, en particulier l'espèce intestinale Faecalibacterium duncaniae
- Solides connaissances en physico-chimie et en microbiologie
- Connaissances théoriques sur les vésicules extracellulaires : structure, fonctions, mécanismes de formation.
- Maîtrise de l'anglais scientifique écrit et oral

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