Ingénieur en Biologie Synthétique et Automatisation Réf. 2025-1282 H/F - Sorbonne Université– Services Universitaires

L'Unité Mixte de Service Biofonderie de l'Alliance Sorbonne Université a pour mission de mettre en place une offre de services technologiques, de partenariats et de formation de haut niveau en bio-ingénierie à destination des formations universitaires, des laboratoires académiques et des entreprises du secteur, avec l'ambition affichée de structurer la filière de l'ingénierie du vivant depuis son niveau fondamental jusqu'à ses applications technologiques. La BFASU est la première biofonderie académique en France, une plateforme robotisée de biologie de synthèse. Cette infrastructure d'excellence donne accès aux technologies de pointe nécessaires pour accélérer la recherche fondamentale, la recherche appliquée et translationnelle, le développement industriel et l'innovation. Ses activités sont centrées sur le clonage, le séquençage et le criblage phénotypique à haut débit mais également sur l'ingénierie métabolique et le développement de souches de bioproduction (circuits génétiques, enzymes, voie métaboliques artificielles,...) Cette unité multi-tutelles développe des activités partenariales académiques et industrielles sous la forme de prestations de service ou de projets collaboratifs

Localisation :

Campus Pierre et Marie Curie, 4 place Jussieu 75005 ParisFonctions : Ingénieur-e en biologie synthétique et automatisation
Emploi-type : A1A42 - Ingénieur-e biologiste en plateforme scientifique
Catégorie : A
Corps : IGR
BAP : A

CDD de 2 ans.
A pourvoir à compter de février 2026.

Mission :

L'ingénieur-e de recherche sera chargé-e de concevoir, développer, adapter et expérimenter de nouvelles méthodologies de biologie moléculaire et biologie synthétique pour une biofonderie, une plateforme robotisée de bio-ingénierie. Il/elle devra développer, automatiser et optimiser des méthodes de biologie synthétique appliquées à l'ingénierie automatisée de souches de microorganismes (bactéries et levures principalement). Il/Elle supervisera les projets d'ingénierie et de phénotypage des microorganismes.

Activités principales :

- Concevoir le développement et conduire en spécialiste la mise en place de procédures automatisés pour la modification génétique de microorganismes
- Conseiller les utilisateurs et utilisatrices dans le cadre d'un projet scientifique, évaluer et valider les choix et les options techniques
- Concevoir, développer, mettre en place et conduire en spécialiste l'automatisation des approches de biologie synthétique pour l'ingénierie des bactéries et des levures : utilisation/programmation de robots de transfert de liquide, clonages, automatisation des génotypages, phénotypages simple et repiquages de microorganismes
- Gérer et maintenir les collections de plasmides (briques élémentaires, circuits génétiques) et de souches microbiennes
- Traiter les données (analyser, interpréter et valider les résultats) et en garantir le suivi et la qualité
- Assurer un reporting régulier des projets et communiquer les résultats sous forme de rapports
- Assurer une veille scientifique et technologique dans ses domaines d'activité
- Gérer les moyens techniques et financiers alloués aux activités d'expérimentation
- Former, en interne et en externe, aux principes et à la mise en oeuvre des techniques de l'expérimentation en biologie, encadrement des étudiant-es et utilisateurs-trices
- Appliquer et faire appliquer les règles d'hygiène et de sécurité

Conduite de projets : Oui
Encadrement : Non

Connaissances transversales requises :

- Connaissance approfondie des méthodologies de biologie moléculaire et biologie synthétique (clonages Golden Gate, Gibson assembly, CRISPR-Cas9, transgénèse, recombinaison homologue...)
- Excellente maîtrise des concepts de la biologie synthétique et de la bioproduction (cycles DBTL, standardisation, abstraction, automatisation, biofonderie, bioproduction)
- Excellentes connaissance théoriques et pratiques de la culture, de l'ingénierie et du phénotypage des microorganismes
- Connaissances théoriques et pratiques en microbiologie générale
- Connaissances de base en programmation Python
- Connaissance générale des approche d'IA/ML appliquées à l'ingénierie du vivant
- Notions d'informatique appliquée à l'automatisation des transferts de liquide (robots de pipetage/clonage) et à la gestion informatisée de collections (souches, plasmides, briques d'ADN...)
- Réglementation en matière d'Hygiène et de Sécurité
- Cadre légal et déontologique de l'activité
- Réglementation financière (notion de base)
- Langue anglaise : B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues)

Savoir-faire :

- Concevoir en expert de nouvelles techniques de biologie moléculaire et biologie synthétique (clonage haut débit, génotypage, phénotypage)
- Utiliser les logiciels spécifiques à l'activité (biologie moléculaire, automatisation, gestion de stocks) (par exemple: Genious, SnapGene, Benchling, ELN...)
- Rédiger des documents scientifiques et assurer une gestion des projets scientifiques
- Développer une expertise scientifique et technologique
- Encadrer des étudiants
- Gérer la confidentialité des projets (NDA, propriété intellectuelle, secret des affaires)

Savoir-être :

- Bon relationnel et sens du travail en équipe
- Sens de l'organisation (expérimentation, gestion des stocks et des commandes)
- Capacité de raisonnement analytique

Diplôme réglementaire souhaité : Doctorat
Domaine de formation souhaité: biologie moléculaire, biotechnologies, microbiologie, biochimie