Ingénieur en Biologie Synthétique Réf. 2026-1295 H/F - Sorbonne Université– Services Universitaires

L'Unité Mixte de Service Biofonderie de l'Alliance Sorbonne Université a pour mission de mettre en place une offre de services technologiques, de partenariats et de formation de haut niveau en bio-ingénierie à destination des formations universitaires, des laboratoires académiques et des entreprises du secteur, avec l'ambition affichée de structurer la filière de l'ingénierie du vivant depuis son niveau fondamental jusqu'à ses applications technologiques.

La BFASU est la première biofonderie académique en France, une plateforme robotisée de biologie de synthèse. Cette infrastructure d'excellence donne accès aux technologies de pointe nécessaires pour accélérer la recherche fondamentale, la recherche appliquée et translationnelle, le développement industriel et l'innovation. Ses activités sont centrées sur le clonage, le séquençage et le criblage phénotypique à haut débit mais également sur l'ingénierie métabolique et le développement de souches de bioproduction (circuits génétiques, enzymes, voie métaboliques artificielles,...) Cette unité multi-tutelles développe des activités partenariales académiques et industrielles sous la forme de prestations de service ou de projets collaboratifs.

Plus d'informations https://parisbiofoundry.org/

Localisation : Campus Pierre et Marie Curie, Bâtiment B - 2ème étage, 4 place Jussieu 75005 ParisFonctions : Ingénieur-e de Recherche en Biologie Synthétique

Emploi-type : A1A43 - Ingénieur-e biologiste en laboratoire

Catégorie : A

Corps : IGR

BAP : A

CDD de 18 mois.

A pourvoir à compter de mars 2026.

Mission :

Concevoir, développer et caractériser des microorganismes photosynthétiques génétiquement modifiés dans le cadre d'un projet de valorisation de polymères biosourcés.

Activités principales :

- Concevoir, assembler et tester des constructions génétiques dans un châssis microbien photosynthétique pour la production de polymères biosourcés
- Mettre en oeuvre des stratégies d'ingénierie métabolique afin d'orienter le métabolisme cellulaire vers la biosynthèse des composés d'intérêt, en s'appuyant sur des outils de modélisation métabolique et d'optimisation de flux
- Réaliser la transformation, la sélection et le criblage des souches, en mobilisant des technologies de laboratoire automatisées
- Participer à l'établissement de méthodes d'extraction et de purification de produits intracellulaires et extracellulaires, compatibles avec une évaluation physico-chimique ultérieure
- Conduire des expérimentations en conditions contrôlées pour évaluer les performances des souches (croissance, productivité...), en exploitant des approches de type Design of Experiments (DoE) ou Active Learning
- Participer aux réunions de projet, échanger avec les partenaires, et contribuer à la structuration des livrables attendus (souches, données, protocoles)
- Assurer un reporting régulier des projets, la gestion documentaire des expériences, et la contribution aux livrables intermédiaires et finaux attendus dans le cadre du projet de prématuration.
- Gérer et maintenir les collections de plasmides (briques élémentaires, circuits génétiques) et de souches microbiennes
- Traiter les données (analyser, interpréter et valider les résultats) et en garantir le suivi et la qualité
- Assurer une veille scientifique et technologique dans ses domaines d'activité
- Gérer les moyens techniques et financiers alloués aux activités d'expérimentation

Conduite de projets : Oui
Encadrement : Non

Connaissances transversales requises :

- Connaissance approfondie du métabolisme des microorganismes photosynthétiques. Sensibilisation aux enjeux de durabilité, d'économie circulaire et de bioéconomie
- Excellente maîtrise des concepts de la biologie synthétique, de l'ingénierie métabolique et de la bioproduction (cycles DBTL, standardisation, abstraction, modélisation, automatisation, biofonderie, bioproduction)
- Excellentes connaissance théoriques et pratiques de la culture, de l'ingénierie et du phénotypage des microorganismes photosynthétiques (microalgues eucaryotes, cyanobactéries)
- Connaissance générale des approche d'IA/ML appliquées à l'ingénierie du vivant
- Connaissance de l'écosystème français et européen de l'innovation deeptech en biotechnologies (acteurs publics, privés, dispositifs d'accompagnement)
- Intérêt pour la valorisationetl'entrepreneuriat scientifique

Savoir-faire :

- Concevoir en spécialiste des stratégies d'ingénierie métabolique pour la bioproduction de molécules biosourcées (design/redesign, modélisation métabolique, FBA)
- Concevoir, assembler et optimiser en spécialiste des constructions génétiques modulaires pour l'ingénierie métabolique (ex. : Golden Gate, MoClo, CRISPR/Cas9)
- Réaliser des transformations génétiques et des sélections de souches, en mobilisant des techniques de biologie moléculaire et de microbiologie
- Mettre en culture et suivre expérimentalement des microorganismes photosynthétiques dans des conditions phototrophes contrôlées (erlenmeyers, photobioréacteur, scale-up)
- Mettre en oeuvre des protocoles de criblage à haut débit et d'analyse de phénotypes (imagerie, fluorescence, cytométrie, spectrophotométrie)
- Contribuer à l'évaluation de la production et à la caractérisation de composés biosourcés à partir d'outils internes ou en lien avec des plateformes partenaires (techniques analytiques de type GC/LC-MS, RMN, etc.)
- Exploiter des outils d'optimisation et d'analyse de données expérimentales (Design of Experiments, Active Learning, traitement de données de screening, modélisation simple de rendement)
- Documenter rigoureusement les expériences et assurer la production de rapports techniques, de protocoles reproductibles et de livrables projet
- Gérer la confidentialité des projets (NDA, propriété intellectuelle, secret des affaires)

Savoir-faire Transversaux :

- Organiser efficacement son activité dans un cadre expérimental complexe, avec gestion simultanée de plusieurs volets de projet (expérimental, réglementaire, valorisation)
- Prioriser les tâches et respecter les délais dans un environnement contraint (jalons techniques, livrables, échéances de financement)
- Travailler de manière proactive et coordonnée au sein d'une équipe interdisciplinaire et en interaction avec des partenaires externes
...

Suite du Profil Recherché dans la rubrique "Conditions particulières d'exercice"