Ingénieur en Bioinformatique au Sein du Cirb H/F - Collège de France

Le Centre est composé de plusieurs équipes de recherche indépendantes dont les travaux s'intéressent à de multiples aspects de la biologie allant de la théorie, l'evodevo, la microbiologie, la biologie cellulaire et le développement, le cancer, les maladies cardiovasculaires aux neurosciences. Il comprend plusieurs plateformes techniques de pointe en support de ces équipes, en particulier en imagerie et en expérimentation animale. Le CIRB continue à développer des interactions fortes avec des institutions de PSL, telles l'Ecole Normale Supérieure et l'Institut Curie.

Ce poste s'inscrit dans le cadre du projet du PEPR ANRS-MIE Previx, qui porte sur la Préparation pandémique au virus respiratoire X.

Environnement de travail
Vous serez basé.e au CIRB au sein du Collège de France et/ou au CQSB (Laboratoire de Biologie Computationnelle, Quantitative et Synthétique) sur le campus de Jussieu de Sorbonne Université. Vos interlocuteurs principaux seront les Docteurs Samuel Alizon (CIRB) et Laurent Jacob (CQSB), ainsi que les Docteurs François Chevenet (MIVEGEC, Montpellier), Anna Zhukova (IBENS, Paris) et Etienne Simon-Lorière et Sebastian Duchène (Institut Pasteur, Paris).

Missions
Vous serez placé.e sous l'autorité hiérarchique du Docteur Samuel Alizon.

Vos principales missions seront les suivantes :

- Implémenter directement des logiciels existants[1] dans des interfaces web

- Recoder des logiciels existants pour permettre une meilleure intégration en ligne

- Créer un espace web pour héberger différents logiciels

Activités principales
- Conception de logiciels en ligne et sites internet

- Amélioration de logiciels existants

- Rédaction de rapports scientifiques en anglais

- Veille bibliographique

Compétences
- Maîtrise de JavaScript PHP et Python (rust serait un plus)

- Excellentes connaissances en programmation informatique

- Excellentes connaissances en programmation web

- Excellentes connaissances en gestion des bases de données

- Des connaissances théoriques en statistiques et/ou en apprentissage profond seront un plus

- Des connaissances en épidémiologie et/ou en biologie de l'évolution seront un plus

- Excellente maîtrise de l'anglais (écrit lu parlé)

Bac +8 (thèse de doctorat ou diplôme d'ingénieur)