Ingénieur Bioinformaticien CDI Paris H/F - Institut Curie

Rattaché(e) au Chef d'Équipe de Bio-Informatique Clinique, votre activitéconsisteà/au :

- Implémentation de pipelines d'analyses pour le Pôle de Médecine diagnostique et théranostique (notamment pour la génétique, l'immunologie clinique, la pharmacologie et la pathologie numérique)
- Développement d'outils spécifiques au diagnostic clinique
- Calibration et validation des pipelines d'analyses
- Aide à l'interprétation fonctionnelle des résultats à l'aide de solutions internes (bases de connaissance) et de bases de données externes.
- Contribuer à l'évolution et la maintenance des pipelines diagnostiques : Mises à jour, bug reporting, validations
- Participer à l'analyse de projets de recherche associés à des essais cliniques
- Présentation régulière des avancées aux biologistes, présentation des travaux lors de séminaires
- Veille technologique et Expertise des solutions répondant aux demandes des biologistes (tests d'outils / tests des paramètres pour être adapté aux besoins du diagnostic)
- Participation aux groupes de travail nationaux

Profil recherché

Compétences requises :

- Maîtriser l'environnement linux
- Maîtriser au moins l'un des langages de programmation suivants (idéalement avoir de l'expérience sur plusieurs d'entre eux) : python, java, c, c++, R ou autre langage orienté objet
- Bonnes connaissances en algorithmique
- Bonnes connaissances des outils standards de bioinformatique pour l'analyse et l'interprétation des données de séquençage haut-débit (DNA et RNAseq)
- Avoir un attrait pour les interactions avec les biologistes
- Maîtrise de l'anglais technique et scientifique à l'oral et à l'écrit
- Rigueur, dynamisme, capacité à travailler en autonomie
- Excellent esprit d'équipe
- Des compétences dans l'un ou plusieurs domaines suivants seraient un gros plus : utilisation de cluster de calcul (SGE / SLURM / LSF /
MOAB, etc.), expérience en calcul distribué, utilisation de GPU, expérience en machine learning / deep learning
- Des connaissances en immunologie et en oncologie sont un plus

L'Institut Curie est un employeur inclusif respectant l'égalité des chances.

Nos opportunités sont ouvertes à des personnes en situation de handicap.