Thèse les Diptères Synanthropes Comme Vecteurs Passifs du Résistome Rôle Écologique dans la Dissémination des Gènes de Résistance aux Antibiotiques H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université Claude Bernard Lyon 1 École doctorale : E2M2 - Evolution Ecosystèmes Microbiologie Modélisation Laboratoire de recherche : LEM - ÉCOLOGIE MICROBIENNE Direction de la thèse : Guillaume MINARD ORCID 0000000220798844 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-06-09T23:59:59 L'augmentation massive de l'usage des antibiotiques en médecine humaine et vétérinaire accélère la sélection et la diffusion des gènes de résistance aux antibiotiques (GRA), devenus un enjeu majeur de santé publique mondiale. Dans une perspective One Health, ces GRAs circulent entre les compartiments humains, animal et environnement. Si certains vecteurs sont bien identifiés, le rôle d'organismes mobiles capables de relier physiquement ces compartiments reste peu exploré. Les diptères synanthropes, tels que Aedes albopictus et Musca domestica, étroitement associés aux activités humaines, pourraient constituer des interfaces écologiques favorisant la dissémination du résistome.

Ce projet vise à déterminer si ces espèces contribuent à la dispersion passive de bactéries portant des GRA, le long d'un gradient d'anthropisation et à en identifier les mécanismes. En combinant écologie de terrain, biologie moléculaire et expérimentation contrôlée, ce projet évaluera le rôle potentiel des insectes dans la circulation environnementale des résistances. [FR] L'augmentation globale de l'usage des antibiotiques en médecine humaine et vétérinaire constitue l'un des principaux moteurs de la sélection et de la propagation des résistances bactériennes (1). Les bactéries porteuses de gènes de résistance aux antibiotiques (GRA) circulent aujourd'hui entre humains, animaux et environnements selon des dynamiques complexes. Le contrôle de cette dissémination nécessite une approche intégrée One Health (2). Si certains mécanismes de dissémination - effluents hospitaliers, pratiques agricoles, chaînes alimentaires - sont bien documentés, le rôle des organismes mobiles capables de connecter physiquement ces compartiments reste encore peu exploré.
Les insectes synanthropes, et en particulier les diptères tels que le moustique tigre Aedes albopictus et la mouche domestique Musca domestica, constituent des interfaces écologiques mobiles étroitement associées aux activités humaines (3). Le moustique alterne entre hôtes sanguins et milieux aquatiques urbains, tandis que la mouche exploite des substrats organiques variés et fréquente régulièrement les environnements anthropisés et non anthropisés. De par leurs comportements, ils pourraient contribuer à la circulation environnementale des GRA.
Des travaux préliminaires menés par l'équipe d'accueil ont mis en évidence une accumulation importante de GRA chez différentes espèces de diptères et en particulier les mouches domestiques ainsi qu'une capacité expérimentale des moustiques à transférer des bactéries résistantes entre hôtes. Il semble donc nécessaire de mieux comprendre les mécanismes écologiques impliqués.

[EN] The global increase in antibiotic use in human and veterinary medicine is one of the main drivers of the selection and spread of bacterial resistance. Bacteria carrying antibiotic resistance genes (ARGs) now circulate between humans, animals, and environments through complex dynamics. Controlling this dissemination requires an integrated One Health approach. While some dissemination mechanisms - hospital effluents, agricultural practices, food chains - are well documented, the role of mobile organisms capable of physically connecting these compartments remains poorly explored.
Synanthropic insects, and particularly dipterans such as the tiger mosquito Aedes albopictus and the house fly Musca domestica, constitute mobile ecological interfaces closely associated with human activities. The mosquito alternates between blood hosts and urban aquatic environments, while the fly exploits a variety of organic substrates and regularly frequents both anthropised and non-anthropised environments. Through their behaviours, they could contribute to the environmental circulation of ARGs.
Preliminary work carried out in the host laboratory has revealed a significant accumulation of ARGs in various dipteran species, particularly house flies, as well as an experimental capacity of mosquitoes to transfer resistant bacteria between hosts. It therefore seems necessary to better understand the ecological mechanisms involved.

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