Lead en Biologie Computationnelle et IA H/F - Youngr Labs

Le rôle

En tant que Lead en Biologie computationnelle et IA, en collaboration étroite avec le CSO/CTO, vous co-définirez, et exécuterez la stratégie technologique de l'entreprise.

Vous serez responsable de:

- La biologie computationnelle et notre atlas de cellules uniques
- Superviser le développement de notre modèle IA
- L'architecture de la plateforme logicielle
- Le recrutement et la construction de l'équipe technique
- La qualité scientifique des algorithmes développés
- La traduction des avancées scientifiques en un produit adopté par l'industrie

Vous travaillerez à l'intersection de :

- Les données omics à l'échelle de la cellule unique
- Le Machine learning, incluant les foundation models et l'IA générative
- La Drug discovery
- La Bioinformatique
- Le développement informatique

Responsabilités :

Leadership technique

- Piloter et exécuter la feuille de route technologique à 3-5 ans, définie conjointement avec le CSO.
- Constituer et diriger les équipes Machine Learning, Bioinformatique et Software Engineering.
- Mettre en place les meilleures pratiques de développement logiciel, de MLOps et de validation scientifique.
- Piloter les choix d'architecture IA, de cluster interne et de cloud.

Intelligence artificielle & Machine Learning

- Superviser le développement de modèles prédictifs appliqués aux données biologiques.
- Diriger le développement de modèles pour :
- Les foundation models : LLM, modèles de diffusion, world models
- Les horloges du vieillissement fondées sur la transcriptomique
- L'intégration multi-omique
- La prédiction de perturbations
- Potentiellement, les agents IA et systèmes RAG

Génomique & biologie unicellulaire

- Définir et superviser les pipelines d'analyse single-cell.
- Superviser notamment :
- Contrôle qualité, normalisation et correction des effets de lot
- Annotation cellulaire
- Expression différentielle des gènes, biomarqueurs et analyse de voies biologiques
- Inférence de trajectoires cellulaires
- Découverte de biomarqueurs
- Garantir la validité biologique et la robustesse de l'ensemble des résultats.

Produit

- Participer aux échanges avec les clients.
- Définir les indicateurs de performance scientifiques et produit.

Recherche & développement

- Identifier les avancées académiques et technologiques pertinentes.
- Contribuer à la stratégie de propriété intellectuelle de l'entreprise.
- Participer aux publications scientifiques et au développement de brevets.

Formation :

Doctorat ou expérience équivalente dans un ou plusieurs des domaines suivants :

- Génomique
- Biologie computationnelle
- Machine learning
- IA appliquée à la biologie

Expérience requise :

- Plus de 8 ans d'expérience pertinente.
- Formation au sein d'universités ou établissements de premier plan
- Forte expérience avec les données scRNA-seq.
- Expertise solide en génomique et machine learning.
- Expérience dans le développement de logiciels prêts pour la production.
- Excellente maîtrise de Python.

Expérience appréciée :

- Expérience en startup / environnement à rythme soutenu.
- Expérience dans la techbio, la biotech ou l'industrie pharmaceutique.
- Expérience en leadership technique / management.
- Une expérience dans la biologie du vieillissement est un atout.

Compétences techniques

Single-cell & omics :

- scRNA-seq
- Human Cell Atlas
- Workflows 10x Genomics
- Intégration multi-omique

Machine Learning :

- Deep Learning
- Foundation Models
- Transformers
- Representation Learning
- Self-supervised Learning
- Multimodal Learning

Bioinformatique :

- Scanpy
- AnnData
- Seurat
- Bioconductor
- Nextflow
- Snakemake

Software Engineering :

- Python
- PyTorch
- FastAPI
- Docker
- Kubernetes
- PostgreSQL
- Bases de données vectorielles

Infrastructure :

- AWS
- GCP
- MLOps
- CI/CD
- Infrastructure as Code (IaC)

Nous construisons une plateforme d'intelligence artificielle dédiée à l'analyse de données biologiques complexes, avec un focus initial sur la transcriptomique à l'échelle cellulaire (scRNA-seq), la génomique et la recherche de nouveaux traitements dans le domaine du vieillissement et des maladies liées à l'âge.

Notre ambition est d'accélérer la découverte de futurs traitements capables de ralentir ou de combattre le vieillissement et les pathologies associées.

Rémunération & avantages

- Rémunération compétitive.
- Package significatif en equity / stock-options.
- Possibilité de rejoindre l'aventure en tant que cofondateur·rice.
- Influence directe sur la stratégie de l'entreprise.
- Opportunité de construire une entreprise deep-tech à l'intersection de l'IA et de la biologie.